More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0090 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0090  Fumarylacetoacetase  100 
 
 
394 aa  768  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  57.64 
 
 
405 aa  400  1e-110  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  59.17 
 
 
398 aa  400  1e-110  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  54.21 
 
 
404 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  57.36 
 
 
398 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  56.85 
 
 
398 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  54.98 
 
 
397 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  53.19 
 
 
413 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  56.66 
 
 
378 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  56.33 
 
 
394 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.242132 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  51.33 
 
 
412 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  56.07 
 
 
423 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  51.3 
 
 
394 aa  357  2e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18890  fumarylacetoacetate hydrolase  50.26 
 
 
412 aa  338  1e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0251227  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  55.67 
 
 
401 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  52.6 
 
 
391 aa  329  5e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0803  Fumarylacetoacetase  51.89 
 
 
403 aa  320  2e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.394865  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  43.47 
 
 
416 aa  304  2e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  42.65 
 
 
418 aa  294  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  43.42 
 
 
401 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  43.84 
 
 
433 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  43 
 
 
415 aa  284  2e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  42.65 
 
 
420 aa  283  5e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  41.43 
 
 
434 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  41.59 
 
 
436 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  41.78 
 
 
436 aa  280  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  42.05 
 
 
429 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  43.54 
 
 
422 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  41.75 
 
 
436 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  40.9 
 
 
434 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  44.69 
 
 
413 aa  276  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  43.37 
 
 
423 aa  275  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  40.66 
 
 
434 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  40.38 
 
 
434 aa  274  2e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  40.71 
 
 
434 aa  273  4e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  40.52 
 
 
434 aa  273  5e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  40.61 
 
 
434 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  41.81 
 
 
435 aa  272  8e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  40.85 
 
 
432 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  40.58 
 
 
427 aa  270  3e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  43.03 
 
 
422 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  40.97 
 
 
435 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  40.97 
 
 
435 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  40.97 
 
 
435 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  40.97 
 
 
449 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  43.67 
 
 
390 aa  269  6e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  42.47 
 
 
422 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  41.79 
 
 
423 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  41.89 
 
 
429 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  41.79 
 
 
423 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  41.87 
 
 
422 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  40.97 
 
 
435 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  40.85 
 
 
449 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  40.97 
 
 
886 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  43.69 
 
 
420 aa  265  7e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  40.38 
 
 
429 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  40.93 
 
 
424 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  40.19 
 
 
434 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  49.5 
 
 
421 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  44.12 
 
 
421 aa  259  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  39.51 
 
 
427 aa  257  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  42.22 
 
 
432 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  42.45 
 
 
432 aa  254  2e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  5.07003e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  40.14 
 
 
425 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  41.61 
 
 
431 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  37.88 
 
 
431 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  46.11 
 
 
436 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  40.9 
 
 
426 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  41.05 
 
 
429 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  39.86 
 
 
438 aa  249  7e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  38.17 
 
 
438 aa  249  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  41.4 
 
 
413 aa  246  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  39.56 
 
 
429 aa  245  1e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  45.54 
 
 
435 aa  244  2e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  38.88 
 
 
437 aa  244  2e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  39.76 
 
 
431 aa  243  4e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  39.61 
 
 
424 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  39.9 
 
 
417 aa  242  7e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  41.15 
 
 
444 aa  240  3e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  39.01 
 
 
424 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  39.86 
 
 
445 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  39.01 
 
 
434 aa  239  6e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  39.76 
 
 
431 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  43.73 
 
 
437 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  39.53 
 
 
430 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  40.24 
 
 
430 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  40.24 
 
 
430 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  45.81 
 
 
430 aa  234  1e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  40.05 
 
 
431 aa  234  2e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  44.09 
 
 
438 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  40.19 
 
 
436 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  38.82 
 
 
431 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0100  fumarylacetoacetase  38.42 
 
 
441 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2380  fumarylacetoacetase  36.26 
 
 
440 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  35.75 
 
 
462 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  38.12 
 
 
440 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  38.17 
 
 
436 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  36.87 
 
 
450 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  36.77 
 
 
441 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  38.2 
 
 
440 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>