44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0085 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  100 
 
 
264 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  66.25 
 
 
241 aa  301  8e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  53.36 
 
 
257 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  55.82 
 
 
277 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  54.58 
 
 
256 aa  241  8e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  51.78 
 
 
264 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  52.92 
 
 
259 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  54.03 
 
 
255 aa  233  2e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  51.11 
 
 
268 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  51.11 
 
 
268 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  52.53 
 
 
259 aa  218  8e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  52.53 
 
 
259 aa  218  8e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  51.03 
 
 
268 aa  208  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  49.4 
 
 
286 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  46.18 
 
 
256 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  47.06 
 
 
267 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  46.18 
 
 
256 aa  184  1e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  45.7 
 
 
259 aa  184  2e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  48.19 
 
 
258 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  42.8 
 
 
260 aa  179  5e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.53852e-12 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  45.23 
 
 
273 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  43.98 
 
 
282 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  44.8 
 
 
269 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  44.21 
 
 
263 aa  172  4e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  44.74 
 
 
296 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  44.44 
 
 
253 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  42.45 
 
 
255 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  42.34 
 
 
437 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  41.45 
 
 
293 aa  148  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  43.97 
 
 
272 aa  148  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  39.84 
 
 
269 aa  146  4e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  44.96 
 
 
242 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  53.12 
 
 
302 aa  135  6e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  35.63 
 
 
295 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  33.33 
 
 
251 aa  54.3  2e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  30.68 
 
 
242 aa  51.2  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  33 
 
 
360 aa  48.9  9e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4420  abortive infection protein  38.46 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06754  hypothetical protein  32.86 
 
 
281 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0732  abortive infection protein  34.26 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.374591 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.80726e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  33.72 
 
 
210 aa  42  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  25.69 
 
 
313 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2226  CAAX amino terminal protease family protein  27.74 
 
 
299 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>