66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0080 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0080  protein of unknown function DUF952  100 
 
 
108 aa  213  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  57.27 
 
 
117 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  45.61 
 
 
117 aa  84.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  43.24 
 
 
129 aa  82  2e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  37.27 
 
 
115 aa  81.6  3e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  39.09 
 
 
111 aa  81.3  4e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  43.64 
 
 
118 aa  79  2e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  43.64 
 
 
142 aa  76.6  1e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  43.64 
 
 
142 aa  76.6  1e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  43.64 
 
 
142 aa  76.6  1e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  39.81 
 
 
125 aa  72.8  1e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  45.1 
 
 
374 aa  71.6  3e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  41.23 
 
 
114 aa  67.4  6e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  37.17 
 
 
114 aa  64.7  4e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  32.69 
 
 
121 aa  63.5  1e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  37.9 
 
 
124 aa  63.2  1e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  32.74 
 
 
116 aa  62.4  2e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4550  hypothetical protein  43.9 
 
 
115 aa  60.1  1e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0102  hypothetical protein  44.58 
 
 
115 aa  58.9  2e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  29.63 
 
 
120 aa  56.2  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  29.63 
 
 
120 aa  55.8  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  31.78 
 
 
106 aa  55.1  3e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.66115e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  29.46 
 
 
114 aa  53.5  8e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  30.28 
 
 
106 aa  52.8  1e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  34.21 
 
 
115 aa  52.4  2e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  30 
 
 
107 aa  52.4  2e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.44787e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  34.91 
 
 
116 aa  52  3e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  33.02 
 
 
117 aa  52  3e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4927  protein of unknown function DUF952  39.05 
 
 
107 aa  50.8  7e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  33.02 
 
 
117 aa  50.4  8e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  32.98 
 
 
117 aa  49.7  1e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0162  hypothetical protein  34.38 
 
 
115 aa  49.3  2e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  29.29 
 
 
110 aa  49.3  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 
323 aa  49.3  2e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  32.43 
 
 
115 aa  48.9  3e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2622  hypothetical protein  27.68 
 
 
112 aa  48.5  3e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0382701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2820  hypothetical protein  27.68 
 
 
110 aa  48.1  4e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.65343e-09 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2813  hypothetical protein  27.68 
 
 
110 aa  48.1  4e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0272117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2538  hypothetical protein  28.57 
 
 
112 aa  48.1  4e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.070285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1743  hypothetical protein  39.56 
 
 
117 aa  48.1  4e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0395902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  31.58 
 
 
112 aa  47.4  6e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  31.58 
 
 
112 aa  47.4  7e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2571  hypothetical protein  27.68 
 
 
112 aa  47  8e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.05599e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  32.98 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  37.17 
 
 
286 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.84 
 
 
323 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  30.19 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  30.19 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0192  protein of unknown function DUF952  30.85 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1680  protein of unknown function DUF952  33 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  29.91 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  31.48 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3013  hypothetical protein  32.63 
 
 
112 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  28.57 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  30.19 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  28.57 
 
 
114 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0465  hypothetical protein  27.68 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  30.19 
 
 
128 aa  42.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2897  hypothetical protein  32.99 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  30.19 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  26.79 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  27.88 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  31.13 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  29.79 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1917  hypothetical protein  29.63 
 
 
117 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0606069  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  29.81 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0372909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>