125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0079 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 314 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  64.26 
 
 		 292 aa  320  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  60.53 
 
 		 318 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  52.22 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  44.69 
 
 		 327 aa  231  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  46.42 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  45.37 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  48.54 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  44.92 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  43.88 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  40.43 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  42.95 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  41.64 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  41.19 
 
 		 390 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  43.07 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  42.76 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  41.4 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  38.04 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  39.64 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  37.28 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 		 914 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  70.83 
 
 		 914 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2607  preprotein translocase, SecA subunit  61.29 
 
 		 900 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.065848  hitchhiker  0.000000000349821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  51.85 
 
 		 902 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2268  protein translocase subunit secA  78.95 
 
 		 955 aa  46.2  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  54.55 
 
 		 906 aa  46.2  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0973  preprotein translocase, SecA subunit  48.48 
 
 		 971 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.16094  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0910  preprotein translocase, SecA subunit  48.48 
 
 		 971 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822535  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  66.67 
 
 		 844 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  65.22 
 
 		 909 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 939 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  65.22 
 
 		 909 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 		 896 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  47.06 
 
 		 896 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 907 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  54.84 
 
 		 916 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  54.84 
 
 		 916 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  56.25 
 
 		 956 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  58.06 
 
 		 902 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  75 
 
 		 949 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 893 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  48.57 
 
 		 944 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  53.57 
 
 		 858 aa  44.3  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  52.78 
 
 		 936 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0525  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 863 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  56 
 
 		 842 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 906 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  56 
 
 		 908 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0990  preprotein translocase subunit SecA  46.67 
 
 		 898 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  56 
 
 		 908 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  56 
 
 		 908 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  56 
 
 		 908 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  56 
 
 		 909 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 903 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2246  preprotein translocase subunit SecA  42.22 
 
 		 939 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1871  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 906 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1730  preprotein translocase, SecA subunit  72.73 
 
 		 935 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  61.54 
 
 		 958 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  70 
 
 		 903 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 901 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  62.96 
 
 		 899 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  60.71 
 
 		 954 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  56 
 
 		 908 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  72.22 
 
 		 884 aa  43.1  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  56 
 
 		 907 aa  43.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 970 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0685  preprotein translocase, SecA subunit  61.9 
 
 		 931 aa  43.1  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 970 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 970 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1990  preprotein translocase subunit SecA  60.87 
 
 		 911 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3738  preprotein translocase, SecA subunit  58.62 
 
 		 947 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361446  normal  0.764216 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 936 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 904 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1072  preprotein translocase subunit SecA  71.43 
 
 		 868 aa  42.7  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0016593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 910 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 904 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 904 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 963 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  70 
 
 		 958 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  86.67 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  86.67 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1366  preprotein translocase, SecA subunit  60.71 
 
 		 997 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.779073  normal  0.444827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  52 
 
 		 917 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  48.57 
 
 		 962 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  50 
 
 		 917 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0101  preprotein translocase subunit SecA  58.33 
 
 		 865 aa  42.7  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.17444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 900 aa  42.7  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  48.57 
 
 		 962 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  48.57 
 
 		 962 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  86.67 
 
 		 901 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  86.67 
 
 		 897 aa  42.7  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  78.95 
 
 		 968 aa  42.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  81.25 
 
 		 915 aa  42.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>