More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0076 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0076  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
349 aa  707  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0950  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  58.96 
 
 
357 aa  406  1e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6053  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  61.27 
 
 
347 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2067  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  56.43 
 
 
345 aa  336  3e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17757  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4734  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.16 
 
 
340 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4820  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.16 
 
 
340 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00201723  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5119  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.84 
 
 
340 aa  284  2e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.55 
 
 
352 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.115682  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1740  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.72 
 
 
334 aa  243  4e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0387  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.34 
 
 
339 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1116  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.3 
 
 
337 aa  198  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3673  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.06 
 
 
330 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7586  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.13 
 
 
335 aa  184  2e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0388  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.55 
 
 
308 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1464  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.02 
 
 
327 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0199  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.81 
 
 
305 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0175  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.97 
 
 
303 aa  163  5e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0560  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.3 
 
 
308 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.667918  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.23 
 
 
300 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2191  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.11 
 
 
284 aa  128  1e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2601  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.21 
 
 
299 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.168335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.35 
 
 
318 aa  121  1e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.83 
 
 
301 aa  120  4e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.08 
 
 
247 aa  114  2e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0638  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.77 
 
 
287 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2127  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.05 
 
 
285 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1005  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.1 
 
 
271 aa  114  4e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.382859  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.42 
 
 
245 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.64 
 
 
315 aa  109  9e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.807095  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0307  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.45 
 
 
319 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2374  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.51 
 
 
277 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0961804  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1764  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.52 
 
 
303 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  4.20026e-13  normal  0.345622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0725  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.95 
 
 
309 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3300  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.87 
 
 
314 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3525  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.16 
 
 
314 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3560  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.87 
 
 
314 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3270  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.87 
 
 
314 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.83 
 
 
243 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.95679e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3517  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.02 
 
 
314 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2310  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.56 
 
 
276 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2470  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.81 
 
 
277 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3503  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.92 
 
 
314 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3514  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  25.99 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1745  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.42 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68144  normal  0.568819 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3215  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.71 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2689  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.5 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.693483  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0487  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.13 
 
 
293 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0210  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.97 
 
 
276 aa  93.2  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2446  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.93 
 
 
287 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2465e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2682  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.93 
 
 
287 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05547e-06 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2205  glycerophosphodiester phosphodiesterase  24.5 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2415  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.93 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.26 
 
 
287 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0579361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2668  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.26 
 
 
287 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.476095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2703  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  25.25 
 
 
287 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  5.18352e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.77 
 
 
276 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3339  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.81 
 
 
600 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000608256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2472  glycerophosphodiester phosphodiesterase  25.59 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.03 
 
 
244 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.83 
 
 
291 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.47655e-07 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.77 
 
 
236 aa  87  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.27 
 
 
242 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.86 
 
 
242 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1338  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.41 
 
 
291 aa  85.9  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.986749  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3985  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.78 
 
 
276 aa  85.5  1e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2972  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.14 
 
 
303 aa  84.7  2e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.74647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.3 
 
 
233 aa  84.7  2e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2863  glycerophosphodiester phosphodiesterase  24.66 
 
 
242 aa  84.3  3e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.02 
 
 
238 aa  83.6  5e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0646  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.88 
 
 
319 aa  83.2  6e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716757  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1167  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.33 
 
 
233 aa  82.8  8e-15  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.485039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2733  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  24.24 
 
 
287 aa  82.8  8e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  24.58 
 
 
249 aa  82.8  8e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0147  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.78 
 
 
302 aa  82.4  1e-14  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5255  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.48 
 
 
263 aa  82  1e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4097  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.37 
 
 
276 aa  81.3  2e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.76 
 
 
289 aa  81.3  2e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0614299  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1048  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.39 
 
 
355 aa  81.3  3e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.77 
 
 
320 aa  80.5  4e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2623  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.56 
 
 
293 aa  80.5  4e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0435  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.51 
 
 
289 aa  80.5  4e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.55 
 
 
241 aa  80.1  5e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.19 
 
 
241 aa  79.7  7e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4183  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.49 
 
 
235 aa  79.7  8e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3461  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.46 
 
 
372 aa  77.8  2e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3495  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.74 
 
 
247 aa  78.2  2e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.464671 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.09 
 
 
594 aa  78.2  2e-13  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3242  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.24 
 
 
380 aa  78.2  2e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0616316  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0785  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.15 
 
 
231 aa  77  4e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000197487 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase GlpQ, putative  25.57 
 
 
349 aa  77  4e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.92 
 
 
235 aa  77  5e-13  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2137  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.65 
 
 
286 aa  76.6  5e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0265891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19720  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.69 
 
 
260 aa  77  5e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1855  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.9 
 
 
271 aa  76.6  6e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.49147e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2954  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.28 
 
 
631 aa  76.6  6e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.35594  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.12 
 
 
241 aa  75.5  1e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  26.55 
 
 
241 aa  75.5  1e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1033  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.99 
 
 
279 aa  75.9  1e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  26.55 
 
 
241 aa  75.9  1e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.09 
 
 
241 aa  75.9  1e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>