More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0071 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  70.26 
 
 
552 aa  655  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03080  SSS sodium solute transporter  71.51 
 
 
528 aa  672  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2862  Na+/solute symporter  75.9 
 
 
537 aa  695  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  76.64 
 
 
552 aa  726  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  71.99 
 
 
541 aa  667  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3373  SSS sodium solute transporter superfamily  76.08 
 
 
536 aa  719  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.346982  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  72.18 
 
 
541 aa  669  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0694  SSS sodium solute transporter superfamily  72.32 
 
 
543 aa  666  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1396  SSS sodium solute transporter superfamily  76.37 
 
 
538 aa  708  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08051e-11 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2139  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  71.99 
 
 
543 aa  677  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  76.07 
 
 
556 aa  713  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06910  SSS sodium solute transporter  73 
 
 
540 aa  689  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1075  SSS sodium solute transporter superfamily  76.91 
 
 
546 aa  699  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.099805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1378  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  76.18 
 
 
538 aa  724  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  72.18 
 
 
541 aa  669  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 
528 aa  1022  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3659  SSS sodium solute transporter superfamily  75.98 
 
 
542 aa  703  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.641913  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12100  SSS sodium solute transporter  78.35 
 
 
532 aa  732  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24513  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  71.8 
 
 
543 aa  675  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252386  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  66.16 
 
 
525 aa  642  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  65.88 
 
 
568 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  65.68 
 
 
537 aa  614  1e-174  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  66.29 
 
 
536 aa  605  1e-172  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  65.18 
 
 
536 aa  603  1e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  68.31 
 
 
545 aa  604  1e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  63.9 
 
 
557 aa  583  1e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  64.05 
 
 
557 aa  583  1e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.99279e-05 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0347  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  63.43 
 
 
534 aa  562  1e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  61.63 
 
 
551 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3815  Na+/solute symporter  59.16 
 
 
584 aa  545  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  57.4 
 
 
561 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.42 
 
 
530 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  51.8 
 
 
516 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  51.8 
 
 
516 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  51.8 
 
 
516 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  51.98 
 
 
516 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  51.8 
 
 
516 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  51.98 
 
 
516 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  51.61 
 
 
516 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.42 
 
 
516 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  51.61 
 
 
516 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  52.87 
 
 
519 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  51.61 
 
 
516 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.85 
 
 
516 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  51.23 
 
 
515 aa  472  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  51.86 
 
 
513 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.29 
 
 
515 aa  470  1e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.99 
 
 
659 aa  459  1e-128  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40042e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  45.86 
 
 
665 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  50.68 
 
 
511 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  48.6 
 
 
559 aa  447  1e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  46.04 
 
 
584 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  45.7 
 
 
584 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.48 
 
 
539 aa  440  1e-122  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  46.72 
 
 
577 aa  440  1e-122  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  45.53 
 
 
584 aa  440  1e-122  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  45.03 
 
 
661 aa  439  1e-122  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.2 
 
 
575 aa  441  1e-122  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  45.91 
 
 
664 aa  436  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  46.08 
 
 
665 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.07835e-14 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  47.46 
 
 
552 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  47.15 
 
 
541 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  47.29 
 
 
552 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2994  Na+/solute symporter  50.18 
 
 
632 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.77047  normal  0.396474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  46.96 
 
 
541 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  46.36 
 
 
576 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.96 
 
 
541 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  46.36 
 
 
576 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  46.55 
 
 
576 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  47.48 
 
 
513 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  45.73 
 
 
577 aa  427  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  46.01 
 
 
551 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  3.16225e-14 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  45.83 
 
 
551 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  44.94 
 
 
551 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  44.18 
 
 
552 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  44.94 
 
 
551 aa  425  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  47.45 
 
 
571 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  46.22 
 
 
574 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  45.53 
 
 
584 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  44.88 
 
 
550 aa  425  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  44.94 
 
 
551 aa  425  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  47.27 
 
 
554 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  46.03 
 
 
572 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  46.57 
 
 
552 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  46.7 
 
 
554 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  46.21 
 
 
563 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  44.36 
 
 
552 aa  422  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  46.89 
 
 
554 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  44.73 
 
 
552 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  44.55 
 
 
548 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  46.7 
 
 
554 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  46.72 
 
 
576 aa  416  1e-115  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  46.72 
 
 
576 aa  416  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  43.77 
 
 
659 aa  417  1e-115  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.46 
 
 
577 aa  416  1e-115  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  43.6 
 
 
657 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  45.37 
 
 
549 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  45.18 
 
 
549 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  43.99 
 
 
552 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  44.03 
 
 
662 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>