128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0070 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  100 
 
 
118 aa  243  5e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  60.17 
 
 
114 aa  154  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  62.28 
 
 
116 aa  150  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  66.36 
 
 
126 aa  150  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  64.76 
 
 
126 aa  143  7e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34862e-11 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  66.35 
 
 
119 aa  140  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  60.19 
 
 
116 aa  129  2e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  55.08 
 
 
121 aa  129  2e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  63.46 
 
 
136 aa  127  5e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  55.45 
 
 
105 aa  127  7e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  55.45 
 
 
105 aa  127  7e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  57.43 
 
 
105 aa  126  8e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  53.91 
 
 
138 aa  126  1e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  58.25 
 
 
122 aa  124  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  52.68 
 
 
115 aa  124  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  55.24 
 
 
110 aa  124  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  56.73 
 
 
111 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  53.98 
 
 
122 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  52.38 
 
 
109 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  56.31 
 
 
110 aa  119  2e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  56.73 
 
 
112 aa  117  5e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  55.21 
 
 
133 aa  114  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  54.72 
 
 
122 aa  114  4e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  2.06604e-05 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  65.98 
 
 
118 aa  113  7e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  60.2 
 
 
115 aa  112  2e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  49.56 
 
 
124 aa  112  2e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  55.43 
 
 
114 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  47.93 
 
 
120 aa  107  8e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  47.37 
 
 
132 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  49.49 
 
 
139 aa  72.4  2e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  38.54 
 
 
148 aa  69.7  1e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  33 
 
 
102 aa  68.6  3e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  32.69 
 
 
102 aa  60.5  8e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  32.69 
 
 
102 aa  58.5  3e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.89397e-06  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  29.7 
 
 
102 aa  58.2  4e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  31.73 
 
 
102 aa  57  1e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  32.32 
 
 
102 aa  55.5  2e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.59671e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  29.17 
 
 
103 aa  55.5  2e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  31.25 
 
 
103 aa  56.2  2e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  1.19739e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  30.69 
 
 
103 aa  55.5  3e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  30.69 
 
 
103 aa  55.5  3e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  31.68 
 
 
102 aa  55.5  3e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  35.16 
 
 
101 aa  55.1  3e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  29.7 
 
 
103 aa  54.7  4e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  30.69 
 
 
103 aa  54.7  4e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  26.73 
 
 
102 aa  53.9  6e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  6.14043e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  26.73 
 
 
102 aa  53.9  6e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  2.43201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  31 
 
 
102 aa  53.9  8e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  31 
 
 
102 aa  53.9  8e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  31 
 
 
102 aa  53.9  8e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  30.21 
 
 
102 aa  53.1  1e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  27.96 
 
 
102 aa  53.1  1e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  30.21 
 
 
102 aa  53.1  1e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  31.52 
 
 
102 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  31.96 
 
 
107 aa  52.4  2e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  33.75 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  28.71 
 
 
103 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  33.75 
 
 
88 aa  52.8  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  31.46 
 
 
107 aa  52.8  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  32.61 
 
 
101 aa  52  3e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  28.71 
 
 
103 aa  52  3e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  31.91 
 
 
102 aa  52  3e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  28.71 
 
 
103 aa  51.6  4e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  27.96 
 
 
102 aa  50.4  8e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  50.1  1e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  29.35 
 
 
101 aa  50.1  1e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  31.52 
 
 
112 aa  50.1  1e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  31.87 
 
 
117 aa  50.1  1e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  24.75 
 
 
113 aa  49.3  2e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  24.75 
 
 
113 aa  49.3  2e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  24.75 
 
 
113 aa  49.3  2e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  24.75 
 
 
113 aa  49.3  2e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  24.75 
 
 
113 aa  49.3  2e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  24.75 
 
 
113 aa  49.3  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  30.11 
 
 
104 aa  48.9  3e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3702  hypothetical protein  28.7 
 
 
114 aa  48.1  4e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  27.55 
 
 
105 aa  47.8  5e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  27.08 
 
 
102 aa  47.8  5e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  26.21 
 
 
113 aa  47.8  6e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  26.6 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  22.77 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  29.03 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  30.43 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  28.26 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  25.81 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  29.52 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  30.21 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56501e-08 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  25.25 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  25.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  25.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  25.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  25.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  25.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  25.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  25.53 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  8.29166e-15 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  27.66 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  25.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  25.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  23.53 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  25.74 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>