More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0069 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  100 
 
 
603 aa  1174  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  55.17 
 
 
579 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  53.77 
 
 
580 aa  493  1e-138  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  54.29 
 
 
578 aa  494  1e-138  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  54.29 
 
 
578 aa  494  1e-138  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  54.29 
 
 
578 aa  494  1e-138  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  53.58 
 
 
580 aa  487  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  52.89 
 
 
580 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  51.71 
 
 
580 aa  469  1e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  54.09 
 
 
546 aa  465  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  4.10087e-05 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  51.99 
 
 
575 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  54.97 
 
 
546 aa  452  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  48.85 
 
 
573 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  44.83 
 
 
591 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  44.23 
 
 
551 aa  382  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  42.86 
 
 
562 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  46.35 
 
 
614 aa  358  2e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  54.58 
 
 
492 aa  261  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  54.39 
 
 
499 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  49.82 
 
 
498 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  50 
 
 
488 aa  237  5e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.94975e-11 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  61.46 
 
 
505 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  62.93 
 
 
495 aa  214  3e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  50 
 
 
693 aa  196  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  29.52 
 
 
590 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.04 
 
 
659 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40042e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.62 
 
 
577 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  48.47 
 
 
518 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  26.21 
 
 
572 aa  151  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  29.03 
 
 
637 aa  149  2e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  26.32 
 
 
566 aa  147  4e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  26.06 
 
 
574 aa  140  5e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  28.25 
 
 
672 aa  135  2e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  2.04813e-05 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  26.71 
 
 
687 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  27.03 
 
 
687 aa  134  4e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  28.42 
 
 
672 aa  134  4e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.14 
 
 
557 aa  134  4e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.99279e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  28.77 
 
 
683 aa  133  1e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1814  SSS sodium solute transporter superfamily  29.02 
 
 
545 aa  132  2e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  28.21 
 
 
683 aa  132  2e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.56 
 
 
671 aa  129  2e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  27.6 
 
 
671 aa  127  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1967  SSS sodium solute transporter superfamily  27.02 
 
 
552 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.732438  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  28.16 
 
 
671 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  27.23 
 
 
576 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.4 
 
 
671 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  27.4 
 
 
807 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.32 
 
 
672 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  27.56 
 
 
671 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  27.56 
 
 
671 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.56 
 
 
671 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.56 
 
 
671 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  27.65 
 
 
671 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  27.65 
 
 
671 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  27.52 
 
 
671 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  27.66 
 
 
671 aa  122  1e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  28.16 
 
 
671 aa  122  1e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  25.36 
 
 
568 aa  121  4e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  26.57 
 
 
681 aa  120  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  27.03 
 
 
671 aa  119  1e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  28.21 
 
 
722 aa  119  2e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  27.27 
 
 
713 aa  116  1e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  26.92 
 
 
705 aa  113  1e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  26.51 
 
 
769 aa  112  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  27.41 
 
 
703 aa  112  2e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  24.7 
 
 
678 aa  112  2e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  35.09 
 
 
513 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  36.72 
 
 
559 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  27.4 
 
 
722 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  31.43 
 
 
541 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  31.43 
 
 
541 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  34.98 
 
 
515 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  27.02 
 
 
702 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  34.34 
 
 
553 aa  107  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  29.63 
 
 
719 aa  107  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  27.83 
 
 
726 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  33.15 
 
 
516 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  33.15 
 
 
516 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  35.11 
 
 
564 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  25.92 
 
 
572 aa  106  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  33.15 
 
 
516 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  33.15 
 
 
516 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  33.15 
 
 
516 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.15 
 
 
516 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  33.15 
 
 
516 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  33.15 
 
 
516 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.92 
 
 
539 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  33.15 
 
 
516 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  33.15 
 
 
516 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  35.67 
 
 
511 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.99 
 
 
516 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  31.32 
 
 
548 aa  105  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.92 
 
 
541 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.17 
 
 
530 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  31.02 
 
 
666 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  36.69 
 
 
554 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  34.64 
 
 
554 aa  104  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  37.2 
 
 
513 aa  104  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  36.69 
 
 
554 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  36.69 
 
 
554 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>