More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0066 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0066  peptidase S49  100 
 
 
290 aa  575  1e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  60.69 
 
 
300 aa  353  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0166  peptidase S49  55.43 
 
 
297 aa  279  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  52.14 
 
 
306 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  50.16 
 
 
300 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  52.19 
 
 
265 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  49.82 
 
 
265 aa  245  8e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  48.8 
 
 
288 aa  239  3e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  48.54 
 
 
290 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  46.86 
 
 
283 aa  233  4e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  53.51 
 
 
287 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  46.89 
 
 
278 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  47.99 
 
 
265 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0527  peptidase S49  48.38 
 
 
286 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585752  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  47.45 
 
 
368 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0571  peptidase S49  46.08 
 
 
286 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  47.45 
 
 
368 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  44.9 
 
 
286 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  48.72 
 
 
288 aa  225  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  51.28 
 
 
286 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  48.72 
 
 
295 aa  225  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  51.28 
 
 
286 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  52.9 
 
 
287 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  47.99 
 
 
265 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  49.66 
 
 
286 aa  222  5e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  45.94 
 
 
283 aa  218  8e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  46.59 
 
 
302 aa  218  9e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  45.49 
 
 
302 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2857  peptidase S49  44.69 
 
 
265 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  47.65 
 
 
267 aa  214  2e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  53.16 
 
 
285 aa  213  4e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  44 
 
 
293 aa  211  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  46.01 
 
 
300 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2589  peptidase S49  44.48 
 
 
292 aa  197  1e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901075  normal  0.113657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  46.31 
 
 
332 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1217  peptidase S49  44.57 
 
 
299 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  46.05 
 
 
329 aa  185  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  39 
 
 
316 aa  184  2e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  41.45 
 
 
315 aa  182  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  44.66 
 
 
333 aa  182  8e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.19 
 
 
339 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.32 
 
 
332 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  45.05 
 
 
333 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  45.05 
 
 
333 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  45.05 
 
 
333 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  47.39 
 
 
349 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  45.05 
 
 
333 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  45.05 
 
 
333 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  45.05 
 
 
333 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  44.66 
 
 
333 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  43.56 
 
 
364 aa  179  6e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  43.6 
 
 
313 aa  179  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2055  peptidase S49  45.91 
 
 
264 aa  178  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.360179  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  43.56 
 
 
364 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  40.68 
 
 
361 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  44.55 
 
 
330 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  44.55 
 
 
330 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  44.55 
 
 
330 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.58 
 
 
326 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  44.17 
 
 
330 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  44.55 
 
 
330 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  39.17 
 
 
320 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  43.33 
 
 
378 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  40.25 
 
 
360 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  40.69 
 
 
387 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  38.89 
 
 
325 aa  174  2e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.8 
 
 
357 aa  174  2e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.66 
 
 
350 aa  173  3e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  44.83 
 
 
326 aa  173  3e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.4 
 
 
329 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.82 
 
 
350 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  44.33 
 
 
326 aa  172  8e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.4 
 
 
329 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.05573e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.86 
 
 
329 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  42.33 
 
 
341 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  39.83 
 
 
394 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  41.03 
 
 
356 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  43 
 
 
329 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  40.25 
 
 
327 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  41.63 
 
 
325 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  2.08532e-05 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  43.56 
 
 
330 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  45.28 
 
 
311 aa  168  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  43.13 
 
 
313 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  43.07 
 
 
330 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  36.7 
 
 
316 aa  166  3e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  41.05 
 
 
350 aa  166  3e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  41.74 
 
 
311 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1966  peptidase S49  44.26 
 
 
265 aa  164  2e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  38.36 
 
 
313 aa  164  2e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.36 
 
 
313 aa  164  2e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  39.66 
 
 
336 aa  163  2e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  38.61 
 
 
347 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  38.76 
 
 
321 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  36.03 
 
 
312 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  39.91 
 
 
323 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  44.33 
 
 
325 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  39.5 
 
 
340 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  43.72 
 
 
321 aa  158  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1066  family S49 unassigned peptidase  38.28 
 
 
334 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2639  peptidase S49  42.36 
 
 
347 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>