More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0064 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
428 aa  872  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  55.2 
 
 
428 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  53.44 
 
 
394 aa  357  2e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  51.03 
 
 
411 aa  353  3e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  49.74 
 
 
394 aa  352  6e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  51.92 
 
 
394 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  49.73 
 
 
408 aa  348  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  49.32 
 
 
374 aa  338  2e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  48.59 
 
 
398 aa  337  2e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  50.28 
 
 
391 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  48.54 
 
 
408 aa  325  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  5.40633e-06 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  49.05 
 
 
393 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64266e-11 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  50 
 
 
402 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  48.51 
 
 
403 aa  314  2e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  48.25 
 
 
405 aa  314  2e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  48.51 
 
 
403 aa  314  2e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  48.51 
 
 
403 aa  314  2e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  48.14 
 
 
408 aa  313  3e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  48.43 
 
 
409 aa  313  3e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  47.75 
 
 
394 aa  308  1e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  45.38 
 
 
400 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  45.56 
 
 
432 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  42.9 
 
 
363 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12150  putative regulator of cell autolysis  41.86 
 
 
325 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  38.37 
 
 
576 aa  217  3e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  34.17 
 
 
446 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  39.77 
 
 
338 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  35.07 
 
 
426 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  37.28 
 
 
455 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.46246e-08  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  33.78 
 
 
450 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  34.11 
 
 
465 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  37.79 
 
 
572 aa  196  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  31.2 
 
 
578 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.4237e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  33.25 
 
 
580 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  35.92 
 
 
567 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.76 
 
 
576 aa  185  1e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  34.68 
 
 
568 aa  185  1e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  36.08 
 
 
576 aa  184  2e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 
563 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  34.37 
 
 
568 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  32.04 
 
 
556 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 
589 aa  173  6e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  33.24 
 
 
556 aa  172  7e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  31.15 
 
 
603 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  30.03 
 
 
584 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  30.03 
 
 
584 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  31.05 
 
 
575 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  29.57 
 
 
589 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  30.29 
 
 
589 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  30.29 
 
 
589 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  30.29 
 
 
589 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  30.29 
 
 
589 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  30.29 
 
 
589 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  30.29 
 
 
589 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  31.23 
 
 
440 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  30.29 
 
 
589 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3417  signal transduction histidine kinase, LytS  31.71 
 
 
559 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.076956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  31.01 
 
 
563 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  30.38 
 
 
522 aa  167  3e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  34.37 
 
 
560 aa  167  3e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  34.37 
 
 
560 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 
558 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  33.05 
 
 
559 aa  166  6e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  32.29 
 
 
438 aa  166  1e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  30.95 
 
 
557 aa  165  1e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  30.18 
 
 
591 aa  162  8e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  30.72 
 
 
561 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  29.34 
 
 
565 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  30.72 
 
 
563 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  29.06 
 
 
565 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 
561 aa  160  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
561 aa  159  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 
561 aa  159  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 
561 aa  159  9e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  30.43 
 
 
561 aa  159  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  30.43 
 
 
561 aa  159  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  30.43 
 
 
561 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  29.34 
 
 
565 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  33.71 
 
 
564 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.75265e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  30.14 
 
 
561 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  30.1 
 
 
577 aa  156  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  32.35 
 
 
565 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  32.35 
 
 
565 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  29.97 
 
 
591 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  32.81 
 
 
557 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  1.26428e-07 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  32.35 
 
 
559 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  32.81 
 
 
557 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  32.35 
 
 
565 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  32.35 
 
 
559 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  32.35 
 
 
559 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  32.35 
 
 
559 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  30.14 
 
 
561 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  32.35 
 
 
559 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  29.19 
 
 
569 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  32.38 
 
 
565 aa  154  3e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  32.09 
 
 
559 aa  154  3e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  31.2 
 
 
556 aa  154  3e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  30.14 
 
 
561 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  30.14 
 
 
561 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  30.14 
 
 
561 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>