182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0060 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0060  OsmC family protein  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6705  OsmC-like protein  75.71 
 
 
142 aa  221  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252159  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1962  OsmC family protein  71.43 
 
 
141 aa  212  1e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000828142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1377  OsmC family protein  72.34 
 
 
141 aa  210  5e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.841955  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2252  OsmC family protein  71.63 
 
 
142 aa  209  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.11482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7351  OsmC family protein  70.92 
 
 
142 aa  194  2e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1603  OsmC family protein  64.54 
 
 
142 aa  189  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85336e-11 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1608  OsmC family protein  65.49 
 
 
142 aa  185  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.486647  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0697  putative ATP/GTP binding protein  62.14 
 
 
141 aa  173  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1609  OsmC family protein  60.28 
 
 
143 aa  172  2e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4494  OsmC family protein  65.49 
 
 
143 aa  168  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.268183  normal  0.015469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2185  OsmC family protein  60.87 
 
 
143 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03110  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  55 
 
 
145 aa  151  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4020  OsmC family protein  58.45 
 
 
145 aa  151  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216062  normal  0.10554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0597  peroxiredoxin, OsmC subfamily  58.16 
 
 
146 aa  147  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145779  normal  0.0478559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4793  peroxiredoxin, OsmC subfamily  58.16 
 
 
146 aa  146  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32410  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  56.74 
 
 
146 aa  144  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0859  OsmC family protein  54.61 
 
 
146 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407191  normal  0.674013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0142  OsmC-like protein  46.53 
 
 
146 aa  130  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3240  OsmC-like protein  49.65 
 
 
146 aa  129  1e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0122  OsmC family protein  47.95 
 
 
146 aa  126  1e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3017  OsmC family protein  48.92 
 
 
147 aa  123  8e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0093224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37030  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  47.22 
 
 
143 aa  123  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0241406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4026  OsmC family protein  45.71 
 
 
138 aa  120  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0381  OsmC family protein  48.18 
 
 
136 aa  119  1e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.639142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02004  peroxiredoxin OsmC  45.83 
 
 
144 aa  119  2e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2252  osmotically inducible protein  45.77 
 
 
145 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.599611  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3199  OsmC family protein  48.2 
 
 
140 aa  117  4e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3472  OsmC family protein  44.44 
 
 
143 aa  116  1e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.359204  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0059  redox protein, regulator of disulfide bond formation  43.75 
 
 
145 aa  114  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00217443  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1008  OsmC family protein  45.45 
 
 
143 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3760  Peroxiredoxin  44.29 
 
 
143 aa  113  8e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1158  OsmC-like protein  45.45 
 
 
143 aa  113  8e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1108  OsmC family protein  47.83 
 
 
139 aa  112  1e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0956  OsmC family protein  40.85 
 
 
145 aa  112  2e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0144  OsmC family protein  46.81 
 
 
141 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30653  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2843  osmotically inducible protein  48.92 
 
 
139 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5540  peroxiredoxin, OsmC subfamily  50 
 
 
141 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0152  osmotically inducible protein  43.36 
 
 
143 aa  111  4e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0040  OsmC-like protein  43.36 
 
 
143 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0059  osmotically inducible protein OsmC  44.6 
 
 
141 aa  109  1e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00710  osmotically inducible protein OsmC  44.6 
 
 
151 aa  109  1e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0488  OsmC family protein  46.43 
 
 
140 aa  107  4e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.358629  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0303  OsmC-like protein  45 
 
 
140 aa  108  4e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.263241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0104  OsmC family protein  44.6 
 
 
141 aa  107  4e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0089  OsmC family protein  44.6 
 
 
141 aa  107  4e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2586  OsmC family protein  42.86 
 
 
139 aa  107  4e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.32042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0104  OsmC family protein  44.6 
 
 
141 aa  107  8e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.09604e-07 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2175  OsmC family protein  43.36 
 
 
143 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2165  OsmC family protein  43.36 
 
 
143 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2450  OsmC family protein  40.56 
 
 
143 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0107  OsmC family protein  43.17 
 
 
141 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369432 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1664  peroxiredoxin OsmC  43.36 
 
 
143 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01440  osmotically inducible, stress-inducible membrane protein  43.36 
 
 
143 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21953  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01452  hypothetical protein  43.36 
 
 
143 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.219956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1567  peroxiredoxin OsmC  43.36 
 
 
143 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1994  OsmC family protein  40.56 
 
 
143 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2238  OsmC family protein  44.29 
 
 
140 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8088  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0097  OsmC-like protein  41.96 
 
 
143 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1364  OsmC family protein  48.94 
 
 
140 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.680071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1745  peroxiredoxin OsmC  43.36 
 
 
143 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234599  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0585  osmotically inducible protein OsmC  44.29 
 
 
140 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4453  OsmC family protein  41.73 
 
 
141 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1677  peroxiredoxin OsmC  42.66 
 
 
143 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1780  peroxiredoxin OsmC  42.66 
 
 
143 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.778339  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1602  peroxiredoxin OsmC  42.66 
 
 
143 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.746338  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1679  peroxiredoxin OsmC  42.66 
 
 
143 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.495721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1740  peroxiredoxin OsmC  42.66 
 
 
143 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1145  putative OsmC-like protein  44.6 
 
 
141 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764464  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5772  OsmC family protein  41.61 
 
 
140 aa  103  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.255484  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5465  OsmC family protein  44.6 
 
 
141 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1538  OsmC-like protein  43.26 
 
 
142 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2899  OsmC family protein  38.24 
 
 
141 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5086  OsmC family protein  41.26 
 
 
143 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.822138 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2094  peroxiredoxin OsmC  42.66 
 
 
143 aa  103  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5463  osmotically inducible protein OsmC  39.86 
 
 
143 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3669  OsmC family protein  43.66 
 
 
147 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2374  OsmC-like protein  44.68 
 
 
142 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0467379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4150  OsmC family protein  41.43 
 
 
145 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0009  OsmC family protein  40.71 
 
 
145 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2104  OsmC family protein  39.86 
 
 
146 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0212711  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0007  OsmC family protein  41.43 
 
 
145 aa  101  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7145  OsmC family protein  41.18 
 
 
138 aa  100  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01800  OsmC-like protein  43.88 
 
 
141 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0270065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0580  OsmC-like protein  42.14 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.207251  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2304  OsmC family protein  42.96 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  hitchhiker  0.00777358 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2716  peroxiredoxin, OsmC subfamily  44.2 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.126465  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2339  OsmC family protein  43.38 
 
 
136 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5587  peroxiredoxin, OsmC subfamily  46.21 
 
 
145 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1401  OsmC-like protein  43.28 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3664  Peroxiredoxin  40.69 
 
 
146 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3272  osmotically inducible protein C  41.43 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2579  OsmC family protein  42.96 
 
 
143 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3986  OsmC-like protein  42.86 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0862185  normal  0.347334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2041  OsmC family protein  39.16 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.811079  normal  0.341975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2261  OsmC family protein  42.25 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.427996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7122  OsmC family protein  42.22 
 
 
171 aa  97.1  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1421  OsmC-like protein  42.22 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2726  peroxiredoxin, OsmC subfamily  37.59 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102217 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2091  Peroxiredoxin  39.16 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.481334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>