More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0058 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  100 
 
 
354 aa  700  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.06 
 
 
291 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  47.65 
 
 
257 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  37.65 
 
 
244 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
245 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  37.06 
 
 
317 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40 
 
 
246 aa  75.1  2e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
261 aa  73.2  6e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.91 
 
 
246 aa  70.9  3e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  40.91 
 
 
246 aa  70.9  3e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.91 
 
 
246 aa  70.9  3e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
278 aa  70.5  4e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
244 aa  68.9  1e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  38.79 
 
 
239 aa  68.6  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 
261 aa  68.6  2e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  41.9 
 
 
273 aa  67.4  3e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  38.31 
 
 
429 aa  66.2  7e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.65 
 
 
236 aa  66.2  7e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60342e-05 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
240 aa  66.6  7e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 
225 aa  66.6  7e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.66 
 
 
256 aa  66.2  8e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.65 
 
 
238 aa  66.2  9e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2646  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
248 aa  66.2  9e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.676764 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  27.67 
 
 
238 aa  65.9  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.66 
 
 
256 aa  65.9  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  35.66 
 
 
256 aa  65.5  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.4 
 
 
205 aa  65.5  1e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 
269 aa  65.5  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  36.64 
 
 
221 aa  65.5  1e-09  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
265 aa  64.7  2e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
244 aa  64.7  2e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
236 aa  65.1  2e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0121  methyltransferase type 12  24.24 
 
 
330 aa  64.7  2e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.333152 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.66 
 
 
256 aa  65.1  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.61 
 
 
201 aa  64.3  3e-09  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.20373e-07  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 
268 aa  64.3  3e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
265 aa  64.3  3e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  39.47 
 
 
259 aa  64.3  3e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  41.35 
 
 
310 aa  63.9  4e-09  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
240 aa  63.9  4e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  40.4 
 
 
266 aa  63.9  4e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.91 
 
 
263 aa  63.9  4e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  37.96 
 
 
311 aa  63.9  4e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  35.66 
 
 
256 aa  63.9  4e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.56 
 
 
282 aa  63.5  5e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 
226 aa  63.5  5e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  39.25 
 
 
293 aa  63.5  6e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  44.12 
 
 
233 aa  63.5  6e-09  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  1.56795e-05 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
259 aa  63.2  7e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  36.52 
 
 
311 aa  63.2  8e-09  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.57 
 
 
240 aa  62.8  9e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  25.79 
 
 
235 aa  62.8  9e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
216 aa  62.4  1e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  42.98 
 
 
215 aa  62.4  1e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  39.67 
 
 
238 aa  62.4  1e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  43.36 
 
 
240 aa  61.2  2e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
227 aa  61.6  2e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  40.38 
 
 
310 aa  62  2e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
246 aa  61.6  2e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
250 aa  61.6  2e-08  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  33.67 
 
 
265 aa  61.6  2e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
271 aa  61.6  2e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  28.81 
 
 
217 aa  61.6  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  40 
 
 
250 aa  61.2  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
244 aa  61.2  3e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
243 aa  61.2  3e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
252 aa  60.8  3e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2080  methyltransferase type 12  30.16 
 
 
329 aa  61.2  3e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  39.42 
 
 
285 aa  60.8  3e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  38.74 
 
 
236 aa  61.2  3e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.51 
 
 
279 aa  61.2  3e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
675 aa  60.8  3e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
219 aa  60.5  4e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
207 aa  60.5  4e-08  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  35.65 
 
 
310 aa  60.5  4e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.58 
 
 
260 aa  60.8  4e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  41.58 
 
 
231 aa  60.5  4e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
199 aa  60.5  5e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
243 aa  60.1  5e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
1106 aa  60.5  5e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.04 
 
 
202 aa  60.1  6e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  32.43 
 
 
226 aa  60.1  6e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  33.74 
 
 
274 aa  60.1  6e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  40.95 
 
 
225 aa  60.1  6e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  35.58 
 
 
253 aa  60.1  6e-08  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.5 
 
 
230 aa  59.7  7e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
239 aa  59.7  7e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
266 aa  59.7  7e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38 
 
 
200 aa  59.7  8e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  36.11 
 
 
311 aa  59.7  8e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.62 
 
 
296 aa  59.7  8e-08  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
200 aa  59.3  9e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
255 aa  59.3  9e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
239 aa  59.3  9e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25.32 
 
 
235 aa  59.3  9e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
200 aa  59.3  9e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  34.59 
 
 
262 aa  58.9  1e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 
260 aa  59.3  1e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.61 
 
 
237 aa  59.3  1e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  41 
 
 
331 aa  59.3  1e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>