More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0049 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  57.71 
 
 
601 aa  636  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  63.97 
 
 
607 aa  714  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  56.69 
 
 
599 aa  643  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
593 aa  1173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  60.07 
 
 
600 aa  657  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  70.6 
 
 
594 aa  820  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  62.4 
 
 
597 aa  668  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  55.76 
 
 
594 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  58.32 
 
 
615 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  56.02 
 
 
594 aa  631  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  56.8 
 
 
624 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  54.42 
 
 
593 aa  606  1e-172  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  60.07 
 
 
601 aa  599  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  55.45 
 
 
609 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  54.5 
 
 
594 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  58.33 
 
 
616 aa  582  1e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  53.17 
 
 
613 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  57.03 
 
 
612 aa  552  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  54.65 
 
 
592 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  32.51 
 
 
642 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  34.84 
 
 
630 aa  239  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  35.16 
 
 
586 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  31.62 
 
 
643 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  32.15 
 
 
564 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  32.05 
 
 
590 aa  228  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  31.95 
 
 
570 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  31.35 
 
 
545 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  31.95 
 
 
570 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  31.62 
 
 
570 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  31.62 
 
 
570 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  31.79 
 
 
570 aa  223  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  35.71 
 
 
573 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  31.57 
 
 
570 aa  222  1e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  31.29 
 
 
570 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  33.28 
 
 
553 aa  220  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  31.64 
 
 
568 aa  220  7e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  31.26 
 
 
565 aa  219  9e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  31.4 
 
 
570 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  32.92 
 
 
579 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  32.27 
 
 
593 aa  216  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  31.83 
 
 
563 aa  216  1e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  33.16 
 
 
562 aa  214  3e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  31.2 
 
 
563 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  29.28 
 
 
586 aa  198  2e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  28.91 
 
 
597 aa  193  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  31.25 
 
 
565 aa  193  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  29.25 
 
 
592 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  34.11 
 
 
527 aa  191  3e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  32.15 
 
 
533 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  30.46 
 
 
534 aa  187  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  30.2 
 
 
536 aa  185  2e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  30.68 
 
 
601 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  29.61 
 
 
587 aa  184  4e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0026  gamma-glutamyltransferase  27.85 
 
 
599 aa  184  5e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.165843  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  28.67 
 
 
575 aa  183  8e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  28.23 
 
 
575 aa  183  9e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  29.4 
 
 
533 aa  181  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  30.35 
 
 
529 aa  180  5e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  28.33 
 
 
561 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  27.16 
 
 
587 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  27.58 
 
 
587 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30.29 
 
 
541 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  30.82 
 
 
539 aa  177  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  32.92 
 
 
543 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  29.14 
 
 
581 aa  176  1e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  27.42 
 
 
587 aa  175  2e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  28.74 
 
 
534 aa  176  2e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  9.76792e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  31.07 
 
 
531 aa  175  2e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3168  gamma-glutamyltransferase  24.88 
 
 
604 aa  174  3e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  28.28 
 
 
587 aa  174  4e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  29.2 
 
 
534 aa  174  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  28.25 
 
 
575 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  30.34 
 
 
512 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  25.68 
 
 
556 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  31.99 
 
 
542 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  25.51 
 
 
556 aa  171  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1522  gamma-glutamyltransferase  30.7 
 
 
589 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  26.68 
 
 
583 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  30.52 
 
 
533 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  28.18 
 
 
578 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.229628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1442  Gamma-glutamyltransferase  30.63 
 
 
529 aa  168  3e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284883  normal  0.676031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  32.21 
 
 
557 aa  168  3e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  28.17 
 
 
578 aa  167  7e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  28.45 
 
 
537 aa  167  7e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6605  gamma-glutamyltransferase  32.33 
 
 
529 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  28.08 
 
 
583 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0825  gamma-glutamyltransferase  32.83 
 
 
595 aa  165  2e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1525  Gamma-glutamyltransferase  33.02 
 
 
596 aa  165  2e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0104264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  31.49 
 
 
525 aa  165  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  27.94 
 
 
578 aa  164  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4599  gamma-glutamyltransferase 1  27.18 
 
 
583 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.88152  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  27.38 
 
 
645 aa  162  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  27.9 
 
 
583 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  32.13 
 
 
540 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0780  gamma-glutamyltransferase  31.39 
 
 
568 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  27.8 
 
 
576 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  30.4 
 
 
574 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  26.63 
 
 
645 aa  161  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  27.8 
 
 
576 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  30.96 
 
 
538 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>