24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0046 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  100 
 
 
544 aa  1079  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00680  predicted nuclease (RecB family)  62.39 
 
 
545 aa  642  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  50.97 
 
 
479 aa  400  1e-110  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  49.07 
 
 
576 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  24.22 
 
 
487 aa  67.8  5e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  24.15 
 
 
390 aa  66.2  1e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.02 
 
 
1082 aa  61.6  3e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  22.2 
 
 
494 aa  60.8  7e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  2.12393e-07 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  21.5 
 
 
512 aa  59.7  1e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  25.48 
 
 
493 aa  58.9  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  25.48 
 
 
493 aa  58.9  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  25.08 
 
 
512 aa  57.8  5e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  37.35 
 
 
480 aa  54.3  6e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  31.43 
 
 
1121 aa  53.1  1e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  25.5 
 
 
486 aa  52.4  2e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  19.93 
 
 
490 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.81 
 
 
1151 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  35 
 
 
396 aa  44.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  25.6 
 
 
1280 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0841  RecB family-like nuclease  32.56 
 
 
394 aa  44.3  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0818  RecB family-like nuclease  32.56 
 
 
394 aa  44.3  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1643  DNA repair enzyme  19.67 
 
 
483 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  27.03 
 
 
1163 aa  43.5  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03101  RecB family nuclease  21.27 
 
 
446 aa  43.5  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>