127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0041 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  100 
 
 
182 aa  356  8e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  48.65 
 
 
188 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  48.99 
 
 
197 aa  145  2e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  47.62 
 
 
180 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  40 
 
 
210 aa  86.3  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  50.51 
 
 
284 aa  82.4  3e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  48.08 
 
 
244 aa  81.3  7e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  39.87 
 
 
178 aa  80.9  9e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  37.4 
 
 
174 aa  80.1  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  35.14 
 
 
184 aa  79.7  2e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  40.77 
 
 
174 aa  79  3e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  40.77 
 
 
174 aa  79  3e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  46.24 
 
 
184 aa  76.3  2e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 
172 aa  74.3  9e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  34.01 
 
 
199 aa  73.6  1e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  40.98 
 
 
208 aa  73.6  2e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  32.84 
 
 
207 aa  73.2  2e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.23 
 
 
208 aa  72.4  3e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  33.14 
 
 
564 aa  72  4e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  29.76 
 
 
206 aa  72  4e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  41.84 
 
 
210 aa  70.9  1e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  37.76 
 
 
434 aa  69.7  2e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 
565 aa  69.3  3e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 
593 aa  67  1e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  36.49 
 
 
197 aa  66.6  2e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  35.43 
 
 
197 aa  65.9  3e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.01 
 
 
559 aa  66.2  3e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.23 
 
 
214 aa  65.9  3e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 
560 aa  65.1  5e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  36.59 
 
 
869 aa  65.1  5e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  32.02 
 
 
189 aa  64.3  9e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  35.34 
 
 
198 aa  64.3  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  39.6 
 
 
519 aa  63.2  2e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  35.43 
 
 
141 aa  62.4  3e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  35.43 
 
 
141 aa  62.4  3e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  30.65 
 
 
544 aa  61.6  5e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  41.3 
 
 
605 aa  61.2  7e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  35.07 
 
 
546 aa  61.6  7e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 
229 aa  61.2  8e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 
265 aa  60.5  1e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 
118 aa  60.8  1e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
196 aa  60.1  2e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  36.24 
 
 
226 aa  60.1  2e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.5 
 
 
233 aa  60.1  2e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.03 
 
 
544 aa  59.7  2e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.03 
 
 
544 aa  59.7  2e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  36.07 
 
 
226 aa  59.3  3e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.07 
 
 
226 aa  58.9  4e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  36.51 
 
 
528 aa  58.9  4e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  36.43 
 
 
513 aa  58.2  7e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
223 aa  58.2  7e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  30.08 
 
 
549 aa  57.4  1e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  28.03 
 
 
544 aa  57  1e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  28.03 
 
 
547 aa  57.4  1e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  1.70591e-07 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  34.4 
 
 
203 aa  57.4  1e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  30.91 
 
 
547 aa  57  1e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 
170 aa  56.6  2e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  30.4 
 
 
126 aa  56.2  2e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.5 
 
 
227 aa  56.6  2e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  30.89 
 
 
120 aa  57  2e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  30.65 
 
 
547 aa  56.6  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.36 
 
 
549 aa  56.2  3e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.6184e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.9 
 
 
217 aa  55.8  3e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  36.51 
 
 
539 aa  55.8  3e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  43.56 
 
 
217 aa  56.2  3e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  35.83 
 
 
241 aa  55.5  4e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  37.25 
 
 
144 aa  55.5  4e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  38.64 
 
 
211 aa  55.5  4e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  29.35 
 
 
173 aa  55.1  6e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.31 
 
 
590 aa  54.7  8e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 
607 aa  54.3  9e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 
272 aa  54.3  9e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  37.29 
 
 
571 aa  53.9  1e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  33.86 
 
 
578 aa  53.1  2e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  28.12 
 
 
124 aa  52.4  4e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  36.47 
 
 
206 aa  51.2  7e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  32.33 
 
 
576 aa  51.2  8e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 
137 aa  51.2  8e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  30.56 
 
 
124 aa  50.4  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  30.56 
 
 
124 aa  49.7  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.09371e-12 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  27.34 
 
 
124 aa  49.3  3e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  27.34 
 
 
124 aa  49.3  3e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  27.34 
 
 
124 aa  49.3  3e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  30.56 
 
 
124 aa  49.7  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  27.34 
 
 
124 aa  49.3  3e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.49 
 
 
172 aa  49.7  3e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  30.56 
 
 
124 aa  49.7  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  37.96 
 
 
512 aa  49.3  3e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  27.34 
 
 
124 aa  49.3  3e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  27.34 
 
 
124 aa  49.3  3e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  27.34 
 
 
124 aa  49.3  3e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  31.43 
 
 
124 aa  49.3  3e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  30.39 
 
 
126 aa  48.9  4e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  32.63 
 
 
577 aa  48.9  4e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  32.26 
 
 
130 aa  48.9  4e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  30.19 
 
 
124 aa  48.1  6e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 
551 aa  47.8  8e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  26.56 
 
 
124 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.5 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 
119 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>