26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0038 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
298 aa  583  1e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  55.78 
 
 
295 aa  288  9e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  50.67 
 
 
314 aa  253  2e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  49.67 
 
 
313 aa  244  1e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  41.22 
 
 
310 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  42.71 
 
 
298 aa  183  2e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  39.58 
 
 
302 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  38.64 
 
 
303 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  33.45 
 
 
303 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 
302 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  32.33 
 
 
304 aa  130  2e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  32.82 
 
 
256 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  31.44 
 
 
301 aa  110  2e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 
296 aa  74.3  2e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  23.11 
 
 
313 aa  51.6  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  28.68 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  27.41 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  32.12 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  23.74 
 
 
313 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  28.05 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  31.84 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  29.41 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  37.65 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
316 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  39.34 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>