More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0030 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 
425 aa  848  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  59.86 
 
 
452 aa  461  1e-128  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  52.22 
 
 
435 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  49.07 
 
 
434 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  50.35 
 
 
441 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  49.88 
 
 
438 aa  388  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  1.56043e-06 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  49.88 
 
 
437 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  49.77 
 
 
437 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  50.12 
 
 
473 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  50.23 
 
 
447 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  47.78 
 
 
433 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  44.24 
 
 
427 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  47.42 
 
 
432 aa  349  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  44.29 
 
 
438 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  46.56 
 
 
475 aa  332  8e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  43.39 
 
 
437 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  43.13 
 
 
486 aa  323  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  44.06 
 
 
445 aa  319  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  43.41 
 
 
439 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  42.69 
 
 
436 aa  306  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  40.55 
 
 
428 aa  305  1e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  40.52 
 
 
470 aa  298  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  35.45 
 
 
437 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  35.21 
 
 
437 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  35.66 
 
 
437 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  34.74 
 
 
437 aa  289  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  34.98 
 
 
438 aa  289  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  34.74 
 
 
434 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  1.5326e-08 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  34.74 
 
 
437 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  34.74 
 
 
437 aa  286  3e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  34.51 
 
 
437 aa  285  1e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  34.51 
 
 
437 aa  285  1e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
437 aa  283  3e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  34.65 
 
 
464 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  36.13 
 
 
424 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  33.95 
 
 
442 aa  239  7e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  33.41 
 
 
460 aa  233  7e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  32.56 
 
 
464 aa  232  8e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  34.32 
 
 
440 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.71 
 
 
445 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  34.82 
 
 
417 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  31.13 
 
 
429 aa  222  1e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  32.08 
 
 
469 aa  213  8e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  30.68 
 
 
412 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  31.54 
 
 
423 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  32.56 
 
 
478 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  31.78 
 
 
415 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  31.78 
 
 
415 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  32.01 
 
 
415 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  30.44 
 
 
411 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  32.78 
 
 
439 aa  184  2e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.97 
 
 
409 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.72 
 
 
449 aa  174  2e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  32.46 
 
 
466 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  33.25 
 
 
418 aa  164  4e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.66 
 
 
429 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  31.64 
 
 
574 aa  156  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  32.28 
 
 
421 aa  154  3e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  30.73 
 
 
427 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  31.35 
 
 
413 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  1.42311e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  32.03 
 
 
423 aa  140  4e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  26.91 
 
 
437 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.52 
 
 
417 aa  137  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  30.34 
 
 
430 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 
421 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  26.8 
 
 
556 aa  133  8e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  36.16 
 
 
246 aa  132  1e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  28.77 
 
 
418 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 
448 aa  127  4e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.18 
 
 
462 aa  122  1e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 
424 aa  117  4e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  26.86 
 
 
446 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  29.55 
 
 
483 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  24.14 
 
 
572 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  21.12 
 
 
642 aa  86.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  36.68 
 
 
378 aa  77.4  4e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.75 
 
 
504 aa  75.5  2e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  30.63 
 
 
481 aa  73.6  6e-12  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  24.28 
 
 
468 aa  73.6  6e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.35 
 
 
444 aa  71.6  2e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  32.74 
 
 
448 aa  70.5  5e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  25.16 
 
 
558 aa  70.1  7e-11  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.26 
 
 
433 aa  68.2  3e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  23.92 
 
 
366 aa  67  5e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  21.04 
 
 
475 aa  66.6  7e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 
435 aa  67  7e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  22.05 
 
 
452 aa  66.6  9e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  65.9  1e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  31.9 
 
 
432 aa  65.9  1e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  22.02 
 
 
478 aa  65.1  2e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  32.05 
 
 
480 aa  64.7  3e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  9.29143e-06  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  32.02 
 
 
479 aa  64.7  3e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.69 
 
 
474 aa  64.3  4e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.11 
 
 
453 aa  63.9  5e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 
457 aa  63.9  5e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 
457 aa  63.9  5e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  24.66 
 
 
761 aa  63.2  8e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  21.6 
 
 
478 aa  62.4  1e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 
433 aa  62.8  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  44.93 
 
 
69 aa  62.8  1e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0353708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>