260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0029 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
211 aa  407  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  58.41 
 
 
219 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  56.42 
 
 
220 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.8 
 
 
227 aa  194  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.67 
 
 
218 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  55.56 
 
 
229 aa  188  6e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.5 
 
 
222 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.34 
 
 
218 aa  179  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.09 
 
 
219 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.09 
 
 
219 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.09 
 
 
219 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.7 
 
 
223 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.49 
 
 
220 aa  171  6e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  58.41 
 
 
219 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  8.85422e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  50.24 
 
 
216 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
218 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.63 
 
 
221 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  46.45 
 
 
214 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  48.11 
 
 
214 aa  144  7e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.86 
 
 
230 aa  141  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.21 
 
 
219 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  44.39 
 
 
219 aa  138  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.94 
 
 
216 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 
219 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 
213 aa  134  1e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  38.67 
 
 
227 aa  133  2e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.78 
 
 
230 aa  128  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.91 
 
 
216 aa  127  2e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 
212 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  39.63 
 
 
221 aa  123  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  40 
 
 
215 aa  121  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  38.79 
 
 
215 aa  118  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
214 aa  117  1e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
231 aa  113  2e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.32 
 
 
218 aa  113  2e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  35.16 
 
 
218 aa  109  2e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  32.23 
 
 
212 aa  108  4e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  34.42 
 
 
218 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
215 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 
211 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  29.49 
 
 
218 aa  98.6  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  28.21 
 
 
241 aa  91.3  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.42 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  26.29 
 
 
221 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  26.29 
 
 
221 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  37.68 
 
 
374 aa  88.2  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 
280 aa  84  1e-15  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  35.47 
 
 
216 aa  83.6  2e-15  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
209 aa  83.2  3e-15  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
213 aa  82  6e-15  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 
232 aa  81.6  8e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  34.42 
 
 
224 aa  80.1  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  33.18 
 
 
223 aa  79.7  3e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
219 aa  79  4e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  32.72 
 
 
232 aa  77.8  1e-13  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  30.99 
 
 
227 aa  76.6  2e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  34.17 
 
 
210 aa  76.6  3e-13  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  33.18 
 
 
223 aa  75.9  4e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.61 
 
 
223 aa  75.9  4e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  27.88 
 
 
210 aa  75.5  5e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.4 
 
 
218 aa  75.1  8e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 
212 aa  74.3  1e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  29.63 
 
 
228 aa  73.6  2e-12  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  25 
 
 
221 aa  73.2  2e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  33.03 
 
 
231 aa  73.9  2e-12  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.94 
 
 
211 aa  73.2  3e-12  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  33.7 
 
 
216 aa  71.6  8e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  33.7 
 
 
216 aa  71.6  8e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  33.7 
 
 
216 aa  71.6  8e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
219 aa  71.2  1e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  27.05 
 
 
221 aa  70.1  2e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
298 aa  69.7  3e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  32.29 
 
 
246 aa  69.7  3e-11  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  30.5 
 
 
267 aa  69.3  4e-11  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.78 
 
 
209 aa  68.9  5e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  31.78 
 
 
209 aa  68.9  5e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  31.78 
 
 
209 aa  68.9  5e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  29.91 
 
 
211 aa  68.9  6e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  68.2  8e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  26.19 
 
 
222 aa  67.4  1e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
294 aa  67.8  1e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
227 aa  67  2e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  26.67 
 
 
222 aa  67  2e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  29.33 
 
 
210 aa  66.6  3e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
232 aa  65.9  4e-10  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
228 aa  65.1  8e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
225 aa  64.7  9e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  31.63 
 
 
209 aa  64.7  1e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  33.02 
 
 
209 aa  63.9  1e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
212 aa  63.5  2e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
211 aa  63.9  2e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  31.8 
 
 
297 aa  62.8  4e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.12867e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
309 aa  62.8  4e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  30.43 
 
 
209 aa  62.4  5e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  29.95 
 
 
209 aa  62  7e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  35.29 
 
 
233 aa  61.6  8e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>