More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0025 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
474 aa  943    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  63.08 
 
 
478 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  53.26 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  56.74 
 
 
491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  56.74 
 
 
491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  56.74 
 
 
491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  53.08 
 
 
514 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  48.54 
 
 
505 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  51.13 
 
 
472 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  52.09 
 
 
478 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  46.63 
 
 
519 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  52.11 
 
 
517 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.9 
 
 
516 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  51.97 
 
 
482 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  48.23 
 
 
463 aa  329  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  45.1 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  52.16 
 
 
421 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  44.29 
 
 
474 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  46.39 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  43.61 
 
 
467 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  46.62 
 
 
469 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  42.18 
 
 
540 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  43.65 
 
 
479 aa  289  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  40.63 
 
 
449 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  37.52 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  63.6 
 
 
364 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  43.61 
 
 
466 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  45.24 
 
 
462 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  41.55 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  53.59 
 
 
507 aa  256  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  34.36 
 
 
564 aa  249  9e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  55.27 
 
 
265 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.14 
 
 
241 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  52.72 
 
 
241 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.64 
 
 
438 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  55.38 
 
 
253 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  50.2 
 
 
571 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  52.48 
 
 
259 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  37.1 
 
 
519 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  51.9 
 
 
247 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  46.84 
 
 
567 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  31.28 
 
 
554 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  50.42 
 
 
239 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  46.22 
 
 
558 aa  209  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  49.37 
 
 
239 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  50.21 
 
 
511 aa  202  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  51.42 
 
 
687 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  35.43 
 
 
425 aa  192  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  48.39 
 
 
255 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  33 
 
 
452 aa  192  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
395 aa  192  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  47.39 
 
 
404 aa  190  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  47.11 
 
 
239 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  45.42 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  45.19 
 
 
355 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  43.75 
 
 
361 aa  161  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  38.84 
 
 
238 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  46.93 
 
 
267 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  41.2 
 
 
267 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.18 
 
 
237 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  39.84 
 
 
276 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.71 
 
 
247 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  41.18 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 
241 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  37.18 
 
 
239 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  38.72 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  39.67 
 
 
258 aa  150  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  42.67 
 
 
236 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.97 
 
 
238 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
597 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.84 
 
 
611 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  37.85 
 
 
386 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  37.24 
 
 
259 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
416 aa  143  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  37.24 
 
 
259 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  35.47 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.4 
 
 
271 aa  140  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  38.02 
 
 
325 aa  140  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  36.02 
 
 
236 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  39.75 
 
 
271 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  38.08 
 
 
236 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  38.86 
 
 
262 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  36.64 
 
 
242 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.23 
 
 
245 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  37.07 
 
 
242 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  36.86 
 
 
245 aa  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  34.58 
 
 
245 aa  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  33.73 
 
 
254 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.24 
 
 
261 aa  137  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  36.03 
 
 
243 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.64 
 
 
242 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  37.71 
 
 
320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  37.6 
 
 
240 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  36.55 
 
 
250 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  35 
 
 
250 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  36.1 
 
 
250 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1982  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.7 
 
 
268 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  39.51 
 
 
270 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  40.61 
 
 
381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>