More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0022 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0022  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
567 aa  1118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0878271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00370  serine/threonine protein kinase  82.41 
 
 
419 aa  454  1e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.339035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  68.77 
 
 
464 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  67.72 
 
 
445 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  69.71 
 
 
431 aa  359  8e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  67.26 
 
 
436 aa  357  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  67.62 
 
 
430 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  67.26 
 
 
443 aa  352  9e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  67.26 
 
 
443 aa  352  9e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  67.26 
 
 
443 aa  352  9e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  61.51 
 
 
382 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  58.12 
 
 
562 aa  306  4e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  55.84 
 
 
559 aa  304  3e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4435  serine/threonine protein kinase  56.18 
 
 
542 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  54.35 
 
 
610 aa  293  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  53.99 
 
 
581 aa  292  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.13832e-06 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0062  serine/threonine protein kinase  55.8 
 
 
548 aa  284  3e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  52.9 
 
 
468 aa  284  3e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  52.67 
 
 
614 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00760  probable pknA serine-threonine protein kinase  52.92 
 
 
704 aa  279  8e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  55.67 
 
 
614 aa  276  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  52.33 
 
 
444 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  49.82 
 
 
575 aa  263  9e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  51.29 
 
 
497 aa  259  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3676  serine/threonine protein kinase  54.79 
 
 
501 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.779668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  53.44 
 
 
533 aa  257  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
663 aa  256  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5247  serine/threonine protein kinase  49.3 
 
 
498 aa  256  1e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0047  protein kinase  42.57 
 
 
462 aa  256  1e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576125  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  51.71 
 
 
473 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  53.05 
 
 
554 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0052  serine/threonine protein kinase  41.16 
 
 
475 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  44.65 
 
 
596 aa  249  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0019  serine/threonine protein kinase  49.47 
 
 
556 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  51.59 
 
 
469 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 
450 aa  245  1e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  48.28 
 
 
465 aa  245  1e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3065  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  50.73 
 
 
499 aa  244  2e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.648627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0064  serine/threonine protein kinase  52.49 
 
 
538 aa  244  4e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  48.74 
 
 
503 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0023  protein kinase  51.59 
 
 
481 aa  241  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  48.09 
 
 
568 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  47.08 
 
 
499 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  47.12 
 
 
538 aa  237  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2079  serine/threonine protein kinase  48.08 
 
 
503 aa  237  5e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  46.04 
 
 
477 aa  236  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  42.32 
 
 
480 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.33 
 
 
518 aa  234  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.77 
 
 
591 aa  233  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  45.91 
 
 
585 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  43.12 
 
 
593 aa  232  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.98 
 
 
505 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  46.84 
 
 
1104 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.25 
 
 
603 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.39 
 
 
715 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  43.25 
 
 
609 aa  222  1e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  47.69 
 
 
522 aa  222  2e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.52 
 
 
652 aa  221  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  43.59 
 
 
517 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  42.28 
 
 
666 aa  221  4e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.83 
 
 
667 aa  220  4e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  42.6 
 
 
604 aa  220  6e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  43.85 
 
 
316 aa  219  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.07 
 
 
579 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  43.85 
 
 
320 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  45.58 
 
 
581 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  41.5 
 
 
624 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  41.5 
 
 
624 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  41.5 
 
 
624 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.01 
 
 
647 aa  216  6e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  39.05 
 
 
638 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  40.27 
 
 
651 aa  216  1e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 
612 aa  215  1e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.97 
 
 
681 aa  214  2e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 
763 aa  214  2e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  44.21 
 
 
502 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  44.13 
 
 
736 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.57 
 
 
598 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  1.13845e-05  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  41.5 
 
 
625 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.61 
 
 
584 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.32 
 
 
843 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  41.18 
 
 
625 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.61 
 
 
602 aa  210  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.66 
 
 
650 aa  209  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  40.07 
 
 
692 aa  209  8e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  37.5 
 
 
621 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.11 
 
 
668 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  38.18 
 
 
692 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.81 
 
 
658 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  41.69 
 
 
615 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.3 
 
 
632 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.46 
 
 
613 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  42.07 
 
 
626 aa  207  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  41.64 
 
 
618 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 
691 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0455  serine/threonine protein kinase  45.66 
 
 
530 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.201611  normal  0.0569269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.46 
 
 
664 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  39.27 
 
 
703 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  38.43 
 
 
625 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  42.09 
 
 
642 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>