47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0017 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  100 
 
 		 353 aa  716    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  55.25 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  53.9 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  46.91 
 
 		 234 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  41.08 
 
 		 218 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  38.34 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  38.35 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  35.55 
 
 		 556 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  35.83 
 
 		 521 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  32.7 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  36.05 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  35.83 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  33.78 
 
 		 192 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  34.36 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  32.85 
 
 		 266 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  32.35 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  32.82 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  32.81 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  33.2 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  29.45 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  31.42 
 
 		 229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  30 
 
 		 262 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  33.46 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.46 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  32.64 
 
 		 251 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  27.48 
 
 		 257 aa  89.7  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  29.53 
 
 		 242 aa  89.7  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  26.92 
 
 		 236 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  28.96 
 
 		 316 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  28.4 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  34.41 
 
 		 225 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  34.04 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  33.33 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  30.61 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  29.93 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  29.89 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  33.72 
 
 		 197 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  26.74 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  35.23 
 
 		 200 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  33.7 
 
 		 244 aa  50.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  34.52 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  27.22 
 
 		 291 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  28.87 
 
 		 209 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  33.33 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.74 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0449  sortase family protein  35.96 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  25.16 
 
 		 222 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>