37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0016 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  100 
 
 
88 aa  177  5e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00290  putative septation inhibitor protein  72.73 
 
 
87 aa  111  4e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348658  normal  0.0596427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  52.22 
 
 
90 aa  94.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  53.54 
 
 
97 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0815  putative septation inhibitor protein  51.06 
 
 
93 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144897  normal  0.704435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0071  protein of unknown function UPF0233  52.63 
 
 
95 aa  86.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0012  putative septation inhibitor protein  51.04 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.395634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0020  putative septation inhibitor protein  51.04 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0181383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0012  putative septation inhibitor protein  51.04 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10011  putative septation inhibitor protein  48.94 
 
 
93 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0023  protein of unknown function UPF0233  59.79 
 
 
96 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0019  putative septation inhibitor protein  48.94 
 
 
93 aa  84  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.860021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  42.05 
 
 
84 aa  75.1  3e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0059  protein of unknown function UPF0233  43.96 
 
 
85 aa  74.3  5e-13  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  49.44 
 
 
83 aa  73.9  6e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  43.18 
 
 
81 aa  72.8  1e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5245  protein of unknown function UPF0233  43.96 
 
 
84 aa  69.7  1e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0646831  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0058  hypothetical protein  38.64 
 
 
87 aa  66.6  1e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  42.05 
 
 
81 aa  66.6  1e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6132  hypothetical protein  39.77 
 
 
87 aa  65.9  2e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  44.32 
 
 
84 aa  65.5  2e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0053  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  65.1  3e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282222  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  42.05 
 
 
83 aa  64.3  6e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13441e-11 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  39.18 
 
 
94 aa  62.8  1e-09  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0107  hypothetical protein  40.91 
 
 
81 aa  60.5  9e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0131  hypothetical protein  35.23 
 
 
88 aa  58.5  3e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120533  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1387  putative septation inhibitor protein  34.67 
 
 
158 aa  56.2  2e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  1.80482e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00730  hypothetical protein  32.97 
 
 
101 aa  55.5  2e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4439  hypothetical protein  38.67 
 
 
87 aa  52.4  2e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105645  normal  0.316052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0014  putative septation inhibitor protein  34.44 
 
 
85 aa  51.2  4e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  32.97 
 
 
89 aa  50.8  6e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  40.79 
 
 
110 aa  48.5  3e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27040  Uncharacterised protein family (UPF0233)  31.25 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.596682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00160  hypothetical protein  30.67 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160689  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0027  putative septation inhibitor protein  26.74 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0020  hypothetical protein  35.62 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3067  hypothetical protein  43.4 
 
 
53 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  1.10577e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>