15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0015 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0015  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  270  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00280  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.326036  normal  0.0617221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0816  hypothetical protein  34.88 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128925  normal  0.711897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0018  hypothetical protein  35.94 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.681504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10010  hypothetical protein  36.09 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0011  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0019  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0189767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0011  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0022  hypothetical protein  35.17 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0030  hypothetical protein  46.91 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0024  hypothetical protein  34.13 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8341  hypothetical protein  29.2 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.724069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1681  hypothetical protein  31.67 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.834143  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4994  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4480  hypothetical protein  39.29 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>