103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0010 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  100 
 
 
143 aa  285  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  49.31 
 
 
147 aa  140  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  46.81 
 
 
156 aa  130  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  46.85 
 
 
150 aa  129  2e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  49.23 
 
 
143 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  51.97 
 
 
153 aa  120  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  45.99 
 
 
153 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  40.48 
 
 
161 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  41.61 
 
 
136 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  42.52 
 
 
133 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  41.18 
 
 
135 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  41.73 
 
 
134 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  43.48 
 
 
133 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  44.44 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  41.74 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  44.53 
 
 
148 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  40.85 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  37.88 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  41.54 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  42.64 
 
 
137 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  7.73987e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  41.04 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  40.29 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  40.29 
 
 
140 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  41.46 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  43.55 
 
 
125 aa  87  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  38.89 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  37.4 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  38.21 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  39.26 
 
 
136 aa  82.8  2e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  40.69 
 
 
180 aa  79  2e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  40.69 
 
 
180 aa  79  2e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  40.69 
 
 
180 aa  79  2e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  44 
 
 
185 aa  76.6  9e-14  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  39.17 
 
 
130 aa  75.5  2e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  38.89 
 
 
136 aa  75.5  2e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  34.06 
 
 
144 aa  73.9  6e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  38.89 
 
 
143 aa  72.8  1e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  38.02 
 
 
141 aa  72.4  2e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  41.8 
 
 
132 aa  72.4  2e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  34.13 
 
 
134 aa  72  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  36.44 
 
 
134 aa  70.9  6e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  39.53 
 
 
130 aa  70.1  9e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  34.06 
 
 
134 aa  67  7e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  34.62 
 
 
135 aa  63.9  7e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.88 
 
 
147 aa  63.5  8e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  36.8 
 
 
148 aa  60.5  8e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  37.3 
 
 
148 aa  59.3  2e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.4 
 
 
149 aa  57.4  6e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  32 
 
 
149 aa  55.8  2e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  55.8  2e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  33.6 
 
 
136 aa  55.8  2e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  37.5 
 
 
167 aa  53.9  7e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  30.3 
 
 
136 aa  53.5  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  31.15 
 
 
144 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  33.33 
 
 
144 aa  51.2  5e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  30.4 
 
 
148 aa  48.9  2e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  34.11 
 
 
177 aa  49.3  2e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  33.88 
 
 
159 aa  48.9  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  32.28 
 
 
149 aa  48.9  2e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  35.43 
 
 
147 aa  48.5  3e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  33.33 
 
 
177 aa  48.1  4e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  33.33 
 
 
177 aa  48.1  4e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.06 
 
 
151 aa  48.1  4e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  35.16 
 
 
147 aa  47.8  6e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  35.16 
 
 
147 aa  47.8  6e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  31.78 
 
 
136 aa  47.4  7e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  30.77 
 
 
150 aa  47  9e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  30.47 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  30.77 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  34.38 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  35.43 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  30.71 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  29.66 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  29.63 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92478e-05 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  27.69 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  35.43 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  35.43 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  35.43 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  34.45 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  33.08 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.56426e-09 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  33.6 
 
 
147 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  33.33 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  28.78 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  35.8 
 
 
198 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  30.5 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  28.69 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  31.58 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  1.82197e-11 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  29.77 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0099  DoxX family protein  29.1 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00508391  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  31.11 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.62 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35450  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhC subunit  32 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.975038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  29.13 
 
 
180 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  29.66 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0983  DoxX family protein  29.63 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382706  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  27.27 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  27.34 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  39.44 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  30.95 
 
 
149 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0544  DoxX family protein  27.1 
 
 
131 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>