More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0006 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  54.07 
 
 		 636 aa  694    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.45 
 
 		 636 aa  659    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  52.67 
 
 		 640 aa  672    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  52.52 
 
 		 642 aa  679    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  66.16 
 
 		 661 aa  867    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  52.53 
 
 		 654 aa  674    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  54.53 
 
 		 638 aa  689    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  53.37 
 
 		 635 aa  682    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  54.81 
 
 		 643 aa  683    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  52.22 
 
 		 645 aa  670    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  52.82 
 
 		 640 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  51.06 
 
 		 654 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  51.92 
 
 		 649 aa  669    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  52.75 
 
 		 650 aa  659    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  52.53 
 
 		 643 aa  671    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  52.67 
 
 		 640 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  51.06 
 
 		 654 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  52.67 
 
 		 640 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  51.06 
 
 		 654 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  51.52 
 
 		 635 aa  657    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  51.59 
 
 		 649 aa  644    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  52.67 
 
 		 640 aa  666    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  51.06 
 
 		 654 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  66.02 
 
 		 695 aa  872    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  71.98 
 
 		 661 aa  921    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  51.76 
 
 		 653 aa  666    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  54.46 
 
 		 635 aa  686    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  56.55 
 
 		 633 aa  726    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  53.61 
 
 		 644 aa  693    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  53.72 
 
 		 645 aa  675    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  51.83 
 
 		 644 aa  653    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  50.46 
 
 		 637 aa  683    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  51.77 
 
 		 637 aa  662    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  53.91 
 
 		 650 aa  707    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  55.49 
 
 		 642 aa  698    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  60.67 
 
 		 696 aa  801    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  52.67 
 
 		 640 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  51.06 
 
 		 654 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  51.7 
 
 		 651 aa  661    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  51.06 
 
 		 654 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  52.67 
 
 		 640 aa  667    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 		 640 aa  683    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  51.92 
 
 		 651 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  51.06 
 
 		 654 aa  650    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  52.97 
 
 		 634 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0006  DNA gyrase subunit B  70.78 
 
 		 652 aa  866    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0006  DNA gyrase subunit B  69.25 
 
 		 679 aa  855    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.216936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  49.05 
 
 		 675 aa  676    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  52.52 
 
 		 640 aa  669    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  72.53 
 
 		 675 aa  969    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  57.67 
 
 		 632 aa  736    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  52.52 
 
 		 640 aa  661    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  51.99 
 
 		 646 aa  677    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  53.3 
 
 		 644 aa  693    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.75 
 
 		 636 aa  661    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  54.35 
 
 		 638 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  72.23 
 
 		 675 aa  971    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  57.86 
 
 		 644 aa  766    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  72.82 
 
 		 714 aa  1006    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  52.31 
 
 		 652 aa  669    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.48 
 
 		 638 aa  680    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  50.46 
 
 		 654 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.32 
 
 		 638 aa  680    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  51.53 
 
 		 652 aa  665    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  50.91 
 
 		 654 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52.82 
 
 		 640 aa  670    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  53.29 
 
 		 633 aa  723    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  52.71 
 
 		 651 aa  661    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  64.31 
 
 		 685 aa  811    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  51.06 
 
 		 654 aa  651    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  52.21 
 
 		 642 aa  674    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  64.55 
 
 		 720 aa  855    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  57.93 
 
 		 633 aa  743    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  57.49 
 
 		 644 aa  740    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  55.12 
 
 		 640 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  54.42 
 
 		 640 aa  731    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  53.85 
 
 		 650 aa  675    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  65.22 
 
 		 696 aa  868    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  56.46 
 
 		 628 aa  754    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 		 657 aa  1348    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  72.23 
 
 		 675 aa  971    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  68.65 
 
 		 666 aa  880    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  54.12 
 
 		 642 aa  670    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  49.34 
 
 		 665 aa  643    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  52.84 
 
 		 643 aa  678    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0006  DNA gyrase subunit B  63.1 
 
 		 711 aa  767    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.685499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  51.33 
 
 		 656 aa  657    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  72.23 
 
 		 675 aa  971    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  71.2 
 
 		 675 aa  964    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  67.37 
 
 		 719 aa  866    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  68.68 
 
 		 648 aa  883    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  65.3 
 
 		 686 aa  819    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  54.91 
 
 		 647 aa  679    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  55.12 
 
 		 640 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  52.67 
 
 		 640 aa  672    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  50.76 
 
 		 659 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  51.06 
 
 		 654 aa  648    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  53.69 
 
 		 642 aa  678    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  49.93 
 
 		 651 aa  637    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  53 
 
 		 641 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>