59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0005 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  100 
 
 
143 aa  281  3e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  62.02 
 
 
187 aa  172  1e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  60.47 
 
 
190 aa  160  5e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  60.47 
 
 
190 aa  160  5e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  60.47 
 
 
190 aa  160  5e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  65.12 
 
 
217 aa  158  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  56.25 
 
 
185 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  56 
 
 
188 aa  148  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  57.46 
 
 
184 aa  146  1e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  57.25 
 
 
180 aa  146  1e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  54.69 
 
 
166 aa  143  7e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  53.15 
 
 
188 aa  140  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  50.39 
 
 
134 aa  133  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  55.56 
 
 
185 aa  132  1e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  54.7 
 
 
185 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06889e-13 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  56.34 
 
 
198 aa  130  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  50 
 
 
196 aa  129  2e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  52.31 
 
 
188 aa  125  1e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  47.83 
 
 
177 aa  124  4e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  50.82 
 
 
273 aa  124  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  49.58 
 
 
173 aa  123  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  50.77 
 
 
187 aa  123  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  58.2 
 
 
201 aa  120  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  1.27236e-08 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  47.58 
 
 
196 aa  115  1e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  48.46 
 
 
207 aa  114  4e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  45.69 
 
 
164 aa  110  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  46.46 
 
 
217 aa  108  2e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  51.2 
 
 
171 aa  108  2e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  48.03 
 
 
266 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  48.72 
 
 
183 aa  104  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  47.5 
 
 
206 aa  103  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  45.83 
 
 
179 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  41.59 
 
 
172 aa  87  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  41.67 
 
 
171 aa  80.1  1e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  40.43 
 
 
173 aa  79  2e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  36.04 
 
 
156 aa  75.9  2e-13  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  32.43 
 
 
155 aa  72.4  2e-12  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  37.23 
 
 
117 aa  67  8e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  34.04 
 
 
151 aa  59.7  1e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  32.98 
 
 
153 aa  58.9  2e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  32.95 
 
 
152 aa  53.9  8e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  34.41 
 
 
105 aa  52  2e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  31.11 
 
 
159 aa  50.4  8e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  26.67 
 
 
96 aa  48.9  2e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  49.3  2e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  32.95 
 
 
155 aa  49.7  2e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.65832e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  25.56 
 
 
97 aa  47.8  5e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  31.15 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  29.91 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  1.88483e-05 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  36.92 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0777  hypothetical protein  43.4 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.080705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0498  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  23.33 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  28.17 
 
 
271 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  28.74 
 
 
266 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  31.15 
 
 
86 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.77054e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0672  hypothetical protein  29.73 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04281  hypothetical protein  32.18 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  20 
 
 
97 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>