More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4252 on replicon NC_008766
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 318 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  66.35 
 
 		 359 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  60.5 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  47.65 
 
 		 632 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  44.54 
 
 		 662 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  31.03 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  33.64 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  33.23 
 
 		 423 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 		 361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  32.08 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  32.79 
 
 		 362 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 		 409 aa  142  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  30.18 
 
 		 393 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  34.75 
 
 		 395 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.66 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  30.28 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1414  DNA-cytosine methyltransferase  30.67 
 
 		 419 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.0448096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.36 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.81 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.71 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0534  DNA-cytosine methyltransferase  31.07 
 
 		 399 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0499669  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  27.87 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.45 
 
 		 468 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.39 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1617  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  33.99 
 
 		 415 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  31.56 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 		 465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.54 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  33.12 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  30.24 
 
 		 652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 		 727 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  29.97 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.02 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  26.4 
 
 		 657 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  28.65 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.1 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  25.62 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 		 379 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.75 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  34.74 
 
 		 434 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  30.75 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  27.67 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  28.38 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  26.36 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  33.16 
 
 		 456 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  33.16 
 
 		 456 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  27.79 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  35.29 
 
 		 421 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  30.6 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  29.3 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 		 356 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  32.98 
 
 		 418 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  32.98 
 
 		 418 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.53 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 		 426 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.27 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  36.02 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.93 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  29.18 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  27.44 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  27.98 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.1 
 
 		 362 aa  99.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  26.36 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  33.51 
 
 		 406 aa  99  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  29.11 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  32.66 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  26.01 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 		 416 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  32.66 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 		 454 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  28.65 
 
 		 489 aa  97.4  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  27.02 
 
 		 352 aa  96.3  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.24 
 
 		 431 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.61 
 
 		 671 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  35.8 
 
 		 437 aa  94.7  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 		 406 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  33.51 
 
 		 443 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  26.3 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  28.52 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  26.89 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.45 
 
 		 451 aa  92.8  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  26.02 
 
 		 440 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  26.69 
 
 		 419 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 		 427 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>