34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4226 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4226    100 
 
 		 987 bp  1957    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00338168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  95.74 
 
 		 1992 bp  77.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  89.23 
 
 		 1869 bp  73.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  89.23 
 
 		 1869 bp  73.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  84.07 
 
 		 1821 bp  69.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  93.48 
 
 		 1698 bp  67.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  87.69 
 
 		 1878 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  87.69 
 
 		 1878 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  87.69 
 
 		 2403 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  95 
 
 		 1812 bp  63.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  95 
 
 		 1812 bp  63.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  96.97 
 
 		 1944 bp  58  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2484  DNA primase  92.68 
 
 		 1977 bp  58  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2703  DNA primase  96.97 
 
 		 2001 bp  58  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  88.68 
 
 		 1959 bp  58  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  94.44 
 
 		 1920 bp  56  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  92.5 
 
 		 1815 bp  56  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  92.31 
 
 		 1740 bp  54  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  90.7 
 
 		 1896 bp  54  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4263  DNA primase  89.36 
 
 		 1926 bp  54  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3137  DNA primase  92.31 
 
 		 1962 bp  54  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2130  DNA primase  100 
 
 		 1842 bp  52  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.281855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  90.24 
 
 		 1980 bp  50.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  90.24 
 
 		 1992 bp  50.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6776  DNA primase  93.94 
 
 		 2016 bp  50.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  96.55 
 
 		 1842 bp  50.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  90.24 
 
 		 1983 bp  50.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2962  DNA primase  96.55 
 
 		 2010 bp  50.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  90 
 
 		 1812 bp  48.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  96.43 
 
 		 1749 bp  48.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  88.64 
 
 		 1893 bp  48.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  96.43 
 
 		 1911 bp  48.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  93.75 
 
 		 1971 bp  48.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00401  hypothetical protein  96.43 
 
 		 1866 bp  48.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0389954  normal  0.650566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>