149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4198 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  40.1 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  37.63 
 
 		 208 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  34.55 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  34.36 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2852  resolvase domain-containing protein  53.92 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.049445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  29.38 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  32.32 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  39.47 
 
 		 135 aa  92  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  29.9 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  30.96 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  31.09 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  30.69 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  30.69 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.75 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  30.57 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  30.57 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  27.04 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  30.93 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  26.49 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0876  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0740279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  31.28 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  30.05 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  26.24 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  26.5 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  29.38 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0797  resolvase domain-containing protein  26.87 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000013388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  27.98 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  28.5 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  28.06 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1963  resolvase domain-containing protein  25.49 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0600134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  25.77 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  27.78 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  22.91 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  33.17 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  28.78 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1967  resolvase domain-containing protein  25.5 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.2 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  26.5 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  25.49 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  26.13 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  28 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  31.5 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  27.51 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3075  resolvase domain protein  30.1 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  28.5 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  25.84 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  32.89 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  32.89 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  32.89 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  28.26 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.35 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  33.79 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0024  resolvase, putative  28.16 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000663819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  25.67 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  31.05 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  27.37 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  31.12 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  24.87 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  25.91 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  25.39 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  25.39 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  25.39 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  25.67 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  25.39 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  25.39 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2637  resolvase domain-containing protein  27.69 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  26.94 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0021  resolvase, putative  27.8 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00853796  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  26.35 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  27.15 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  24.87 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2331  resolvase-like protein  27.5 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.385659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  29.15 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  27.04 
 
 		 248 aa  48.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  24.87 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  24.87 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  24.1 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  26.42 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  30.96 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  28.72 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4538  Resolvase domain protein  25.87 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.696146 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  26.03 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  29.44 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  29.44 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  24.84 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1801  resolvase domain-containing protein  24.06 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  25.81 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  28.67 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  34.83 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  27.89 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  27.23 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  30.49 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>