More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4141 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  200  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  98.98 
 
 
98 aa  196  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  79.76 
 
 
105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  69.7 
 
 
96 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  69.15 
 
 
94 aa  134  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  64 
 
 
100 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  71.13 
 
 
117 aa  131  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  64.44 
 
 
112 aa  116  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  63.44 
 
 
105 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  72.46 
 
 
95 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3826  hypothetical protein  67.14 
 
 
120 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  62.86 
 
 
82 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  45.98 
 
 
214 aa  94  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  60.87 
 
 
84 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  61.11 
 
 
80 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
107 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  52.86 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  50 
 
 
206 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  56.16 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  56.52 
 
 
92 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  59.42 
 
 
84 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  59.42 
 
 
84 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  65.15 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  57.33 
 
 
76 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  57.33 
 
 
76 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  57.14 
 
 
99 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  49.28 
 
 
93 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
75 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  56 
 
 
76 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  52.17 
 
 
86 aa  87.8  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  57.14 
 
 
86 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  53.62 
 
 
69 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  54.84 
 
 
73 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  43.75 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.72 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  53.62 
 
 
101 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  53.62 
 
 
89 aa  84.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  51.43 
 
 
70 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  48.65 
 
 
76 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  53.62 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  55.07 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  53.62 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  53.62 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  53.62 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  53.62 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  53.62 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  53.62 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  52.17 
 
 
85 aa  84  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  56.34 
 
 
74 aa  83.6  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 
70 aa  84  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  50.72 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  50.72 
 
 
111 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0003  hypothetical protein  52.17 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296608  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  47.73 
 
 
92 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  49.33 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  46.48 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  43.82 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  51.52 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  45.07 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  45.07 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  53.62 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  45.07 
 
 
78 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  45.07 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  49.28 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  49.28 
 
 
76 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  53.03 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  52.17 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  57.58 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  45.07 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  44.94 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  49.28 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  45.07 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  45.07 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  45.07 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  45.07 
 
 
75 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  45.07 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 
70 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  52.17 
 
 
73 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  52.24 
 
 
91 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
79 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  51.56 
 
 
64 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  45.07 
 
 
72 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 
79 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3459  hypothetical protein  52.86 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  40.37 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0132  hypothetical protein  53.33 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  47.83 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  44 
 
 
77 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>