More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4137 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4137  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.252066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  98.27 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6054  cyclic nucleotide-binding protein  60.26 
 
 		 159 aa  198  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4790  cyclic nucleotide-binding protein  65.88 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4903  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  55.21 
 
 		 163 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5297  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.05 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4111  cyclic nucleotide-binding protein  41.1 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3813  cAMP-dependent protein kinase - catabolite gene activator and regulatory subunit  39.72 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0179  cyclic nucleotide-binding protein  36.84 
 
 		 155 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  39.33 
 
 		 563 aa  64.7  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  27.05 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.74 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  29.92 
 
 		 747 aa  57.8  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  31.01 
 
 		 739 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.29 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.53 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.03 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 598 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  29.85 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  32.46 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.69 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.06 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 225 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.63 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  27.93 
 
 		 729 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  36.28 
 
 		 581 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  30.17 
 
 		 350 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  33.64 
 
 		 577 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.73 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.99 
 
 		 289 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  26.19 
 
 		 322 aa  52  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 227 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  25.81 
 
 		 286 aa  51.6  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.48 
 
 		 242 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  22.96 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  23.58 
 
 		 721 aa  51.2  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  34.41 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 		 425 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 		 425 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 222 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.43 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  27.35 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.96 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  27.35 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  30.65 
 
 		 1053 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  26.96 
 
 		 734 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  23.08 
 
 		 721 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  39.29 
 
 		 528 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.71 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  32 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  28.21 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 226 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.74 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2885  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 321 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  31.87 
 
 		 412 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  37.5 
 
 		 749 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  26 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.85 
 
 		 230 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 228 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  35.14 
 
 		 583 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.3 
 
 		 227 aa  48.5  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  33.01 
 
 		 409 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  35 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.35 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.35 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 243 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  27.35 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  27.35 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  31.18 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  27.35 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  27.35 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  27.35 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  28.7 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  28.32 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  27.35 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  27.35 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  25.41 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>