156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4113 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  99.22 
 
 
387 aa  774    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
387 aa  777    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  77.9 
 
 
372 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  70.18 
 
 
427 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  72.51 
 
 
333 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  65.46 
 
 
362 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  59.38 
 
 
391 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  56.63 
 
 
388 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  59.4 
 
 
360 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  58.43 
 
 
331 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  56.74 
 
 
352 aa  361  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  54.13 
 
 
357 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  53.85 
 
 
357 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  53.28 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  52.44 
 
 
348 aa  335  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  52.74 
 
 
349 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  52.16 
 
 
349 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  52.16 
 
 
349 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  52.16 
 
 
349 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  52.31 
 
 
349 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  53.41 
 
 
350 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  52.31 
 
 
348 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  51.87 
 
 
349 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  51.23 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  50.44 
 
 
346 aa  324  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  51.64 
 
 
344 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  52.6 
 
 
401 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  53.37 
 
 
341 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  47.88 
 
 
348 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  52.01 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  51.72 
 
 
401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  51.44 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  51.44 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  51.44 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  51.44 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  51.44 
 
 
344 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  47.63 
 
 
363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  49.25 
 
 
333 aa  306  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  47.75 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  52.46 
 
 
330 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  47.79 
 
 
333 aa  299  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  49.57 
 
 
338 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  49 
 
 
338 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  52.04 
 
 
341 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  50.96 
 
 
339 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  54.33 
 
 
340 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  47.19 
 
 
340 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
339 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
339 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  47.13 
 
 
341 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  49.04 
 
 
339 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  48.84 
 
 
336 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  45.77 
 
 
339 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  45.76 
 
 
323 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  42.9 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  43.32 
 
 
351 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  40.26 
 
 
340 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  36.23 
 
 
325 aa  220  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  35.93 
 
 
325 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  41.37 
 
 
359 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  43.61 
 
 
341 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  42.11 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  40.72 
 
 
348 aa  216  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  43.32 
 
 
340 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  41.69 
 
 
361 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  39.02 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  41.69 
 
 
347 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  39.76 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  39.51 
 
 
334 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  41.12 
 
 
361 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  38.46 
 
 
348 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  37.57 
 
 
368 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  41.29 
 
 
368 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  40.52 
 
 
363 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  40.52 
 
 
363 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0976  aminoglycoside phosphotransferase  40.66 
 
 
341 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244351  normal  0.0781282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  38.14 
 
 
345 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02246  aminoglycoside phosphotransferase  41.48 
 
 
339 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  43.15 
 
 
344 aa  199  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  31.8 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  37.08 
 
 
342 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  38.34 
 
 
365 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  38.34 
 
 
329 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  39.61 
 
 
338 aa  192  9e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 
379 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  35.95 
 
 
345 aa  189  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  41.2 
 
 
346 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  36.08 
 
 
356 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  36.84 
 
 
379 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  36.25 
 
 
384 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  36 
 
 
379 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  38.96 
 
 
342 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  38.96 
 
 
342 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 
328 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 
360 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3705  aminoglycoside phosphotransferase  32.51 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  39.59 
 
 
328 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3847  aminoglycoside phosphotransferase  33.13 
 
 
347 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.899944  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  36.58 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3845  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>