99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4050 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 426 aa  861    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  98.81 
 
 		 419 aa  832    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  72.41 
 
 		 417 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  58.41 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  59.54 
 
 		 401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  56.4 
 
 		 430 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  57.01 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  54.27 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  55.78 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  46.38 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  44.47 
 
 		 387 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  40.86 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  42.13 
 
 		 395 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  41.48 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  40 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  37.99 
 
 		 343 aa  252  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  36.83 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  37.94 
 
 		 341 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  37.4 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  35.97 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  35.5 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  37.06 
 
 		 383 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  35.97 
 
 		 341 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.98 
 
 		 389 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  35.87 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  35.05 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  34.88 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  31.83 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  33.88 
 
 		 338 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  33.24 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  33.7 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  33.97 
 
 		 338 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.79 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  33.51 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  33.79 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  29.61 
 
 		 368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  31.44 
 
 		 374 aa  156  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  31.2 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  30.67 
 
 		 365 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  32.8 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  30.51 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  29.34 
 
 		 377 aa  150  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  31.78 
 
 		 367 aa  150  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  30.51 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  30.79 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  28.54 
 
 		 377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  29.2 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  29.12 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  30.69 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  30.69 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  30.69 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  28.33 
 
 		 349 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  28.33 
 
 		 349 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  30.43 
 
 		 376 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  29.6 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  29.02 
 
 		 369 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  30.22 
 
 		 353 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  29.79 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  29.9 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  27.81 
 
 		 360 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  27.44 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  29.6 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  25.77 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  28.88 
 
 		 384 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  26.37 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  26.37 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  26.07 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  26.77 
 
 		 435 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  26.54 
 
 		 364 aa  110  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  27.41 
 
 		 359 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  25.74 
 
 		 364 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  28.28 
 
 		 333 aa  106  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  25.07 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  24.93 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  26.9 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  29.18 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  25.53 
 
 		 340 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  22.76 
 
 		 331 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  24.8 
 
 		 333 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  22.76 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  25.82 
 
 		 338 aa  67  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  55.1 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  35.82 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  47.73 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  38.6 
 
 		 935 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  32.53 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  38.46 
 
 		 212 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2244  hypothetical protein  44.23 
 
 		 156 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  37.5 
 
 		 143 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  36.67 
 
 		 663 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  44.19 
 
 		 357 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 1095 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 451 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  37.93 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  40.82 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  37.25 
 
 		 161 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>