More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4020 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
258 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3370  transcriptional regulator, TetR family  98.25 
 
 
228 aa  453  1e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0063882  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4661  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
253 aa  214  1e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.384248  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2413  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
240 aa  199  4e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  45.77 
 
 
247 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
218 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 
372 aa  72  1e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.51 
 
 
263 aa  68.6  1e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
222 aa  62  9e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 
201 aa  61.2  1e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  3.10562e-15 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  26.51 
 
 
227 aa  60.5  2e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
201 aa  60.5  3e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.94535e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 
201 aa  60.1  3e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
213 aa  60.1  3e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  51.85 
 
 
239 aa  60.1  3e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  22.12 
 
 
219 aa  60.5  3e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 
218 aa  60.1  3e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
211 aa  59.7  4e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 
209 aa  60.1  4e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  3.22137e-05 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
209 aa  59.7  4e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
233 aa  59.3  6e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 
233 aa  59.3  6e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
233 aa  59.3  6e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  51.85 
 
 
238 aa  59.3  6e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  51.85 
 
 
238 aa  59.3  6e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
233 aa  59.3  6e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 
245 aa  59.3  7e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
212 aa  58.9  8e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 
225 aa  58.9  8e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
245 aa  58.5  9e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
235 aa  58.9  9e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
201 aa  58.9  9e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
234 aa  58.9  9e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  51.85 
 
 
233 aa  58.5  9e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 
201 aa  58.9  9e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
196 aa  58.9  9e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
235 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
220 aa  58.2  1e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
235 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 
232 aa  58.2  1e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
235 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
235 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  51.85 
 
 
233 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
235 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
213 aa  57.8  2e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
212 aa  57.4  2e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 
202 aa  57.4  2e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
219 aa  57.4  2e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
212 aa  57.4  2e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
212 aa  57.4  2e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
239 aa  57.4  2e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
212 aa  57.4  2e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  47.37 
 
 
213 aa  57.4  2e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 
214 aa  57.8  2e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  9.3152e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
228 aa  57.8  2e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
200 aa  57.8  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
223 aa  57.4  2e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
212 aa  57.4  2e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
211 aa  57.4  2e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
211 aa  57.4  2e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 
203 aa  57.8  2e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
212 aa  57.4  2e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
212 aa  57.4  2e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
212 aa  57.8  2e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  47.37 
 
 
227 aa  57.4  2e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
215 aa  57  3e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
242 aa  57.4  3e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
225 aa  56.6  4e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
219 aa  56.2  6e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 
210 aa  55.8  7e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  42.67 
 
 
207 aa  55.5  7e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
106 aa  55.5  9e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 
208 aa  55.5  9e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
229 aa  55.1  1e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  34.4 
 
 
243 aa  54.7  1e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
226 aa  53.9  2e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 
255 aa  54.7  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 
207 aa  54.3  2e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
221 aa  53.5  3e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 
221 aa  53.5  3e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 
235 aa  53.5  3e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
206 aa  53.5  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
227 aa  53.9  3e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  48.39 
 
 
215 aa  53.5  3e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
226 aa  53.5  4e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  37.68 
 
 
112 aa  53.1  4e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
213 aa  53.1  4e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
204 aa  53.1  4e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
204 aa  53.5  4e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
204 aa  53.5  4e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 
214 aa  53.5  4e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  9.67411e-09 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
238 aa  53.5  4e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
230 aa  53.1  5e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  37.5 
 
 
218 aa  53.1  5e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  42.65 
 
 
208 aa  53.1  5e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 
224 aa  52.8  5e-06  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  32.11 
 
 
212 aa  52.8  5e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
275 aa  53.1  5e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
193 aa  52.8  6e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.812491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>