More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4006 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 109 aa  214  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  99.08 
 
 		 110 aa  213  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  86.81 
 
 		 91 aa  164  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  79.55 
 
 		 91 aa  148  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  78.89 
 
 		 94 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  77.78 
 
 		 93 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  77.27 
 
 		 108 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  75.82 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  62.39 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  70.33 
 
 		 111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 		 107 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  64.22 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  71.59 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  59.63 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  64.22 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  61.47 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  68.18 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  56.88 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  56.88 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  59.26 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  68.13 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  67.05 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  67.05 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  67.05 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  67.05 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  67.05 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  67.05 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  67.05 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  60.19 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  63.22 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  55.96 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  60.67 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  58.43 
 
 		 108 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  55.95 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  65.79 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  45.71 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  45.95 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  46.79 
 
 		 111 aa  103  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  51.72 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  48.11 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  50.59 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  49.43 
 
 		 113 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  51.76 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  45.87 
 
 		 168 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  49.41 
 
 		 111 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  49.41 
 
 		 111 aa  99.4  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  47.92 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  45.87 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  45.54 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  44.23 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  48.81 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  53.57 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  53.57 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  51.81 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  51.19 
 
 		 108 aa  96.7  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  51.19 
 
 		 108 aa  96.7  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  48.84 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  51.28 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  47.22 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  42.2 
 
 		 109 aa  94.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  44.55 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  46.3 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  38.74 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  44.76 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  39.64 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  46.39 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  38.74 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  41.94 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  39.81 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  42.06 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  44.14 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  48.1 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  44.14 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  44.14 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  44.55 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>