96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4000 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4000  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.869888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3350  transcriptional regulator, MarR family  98.78 
 
 		 164 aa  323  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0764351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4639  MarR family transcriptional regulator  80 
 
 		 186 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0875  MarR family transcriptional regulator  83.97 
 
 		 166 aa  260  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0356  MarR family transcriptional regulator  80.79 
 
 		 193 aa  244  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5196  transcriptional regulator, MarR family  74.53 
 
 		 161 aa  237  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4686  MarR family transcriptional regulator  69.94 
 
 		 168 aa  218  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000388035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3957  MarR family transcriptional regulator  70.51 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432771  normal  0.0893513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3949  transcriptional regulatory protein  62.87 
 
 		 179 aa  201  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5060  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 149 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.391119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4123  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00388815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1596  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.665279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3205  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000109713  hitchhiker  0.00541794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2607  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4218  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3964  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528609  normal  0.520443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3876  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3890  MarR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  30.09 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 151 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 143 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  53.49 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 139 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 139 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  31.37 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 156 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  34.65 
 
 		 163 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  37.29 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4190  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  30.11 
 
 		 109 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  23.61 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  29.79 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  36.36 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 140 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 159 aa  42  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 166 aa  42  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  39.06 
 
 		 160 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1316  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 153 aa  42  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.061965 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 167 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 177 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.34 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  40 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  34.85 
 
 		 138 aa  41.6  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  33.82 
 
 		 135 aa  41.6  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  30.95 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 127 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 165 aa  41.2  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 185 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 138 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>