126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3973 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  254  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3323  protein of unknown function DUF35  96.8 
 
 
125 aa  214  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00494403  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  58.77 
 
 
117 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  41.28 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4005  hypothetical protein  40.54 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214613  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  36.97 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  39.42 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  38.52 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  32.69 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  34.91 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  37.76 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3951  hypothetical protein  35.34 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  29.06 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  36 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  38.61 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  37.76 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  37.27 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  37.19 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  34.12 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  34.43 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  31.5 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  38.64 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  29.06 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  35.54 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  31.5 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  31.5 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  35.54 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  34.58 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  39.33 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  30.89 
 
 
311 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  29.52 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  35.48 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  37.66 
 
 
417 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  29.13 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.73 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  34.41 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  30.19 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  32.26 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  30.34 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  30.34 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  32.08 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  34.21 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  36.61 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  29.21 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  29.21 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  29.21 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  32.26 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  29.21 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  29.21 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  29.21 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  32.23 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  32.26 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  31.25 
 
 
417 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  32.14 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  31.71 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  31.2 
 
 
141 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  32.2 
 
 
132 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  30.86 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  37.08 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
413 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  32.48 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  42.17 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  26.21 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  25 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  37.86 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  36.61 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  31.09 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  25.89 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  30.97 
 
 
148 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  30.63 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  36.26 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  25.24 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  30.08 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  25.83 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  35.45 
 
 
305 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4606  hypothetical protein  34.44 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  34.45 
 
 
315 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  35.45 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  27.45 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1359  protein of unknown function DUF35  34.15 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.488871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  30.33 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  21.88 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  37.08 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  30.77 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  28.57 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4070  hypothetical protein  32.29 
 
 
153 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322816  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  31.62 
 
 
127 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  35.29 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  27.68 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  31.36 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  32.98 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  24.03 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  28.7 
 
 
321 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>