More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3940 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
236 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3289  peptidase M22 glycoprotease  99.15 
 
 
236 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4459  peptidase M22, glycoprotease  74.89 
 
 
236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293855  normal  0.853274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0976  peptidase M22 glycoprotease  70.22 
 
 
283 aa  268  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4569  peptidase M22, glycoprotease  73.48 
 
 
260 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  64.73 
 
 
239 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0189  peptidase M22, glycoprotease  59.59 
 
 
239 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3846  peptidase M22, glycoprotease  56.72 
 
 
259 aa  214  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4621  peptidase M22, glycoprotease  58.33 
 
 
260 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  48.37 
 
 
252 aa  164  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  45.93 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  45.06 
 
 
281 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.834993 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  47.15 
 
 
256 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3228  glycoprotease family protein  47.15 
 
 
249 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  47.15 
 
 
249 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  47.15 
 
 
249 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  46.75 
 
 
256 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6032  peptidase M22, glycoprotease  48.36 
 
 
255 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.827723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2045  peptidase M22, glycoprotease  48.36 
 
 
255 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2521  glycoprotease family protein  46.75 
 
 
249 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  46.75 
 
 
249 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2064  peptidase M22 glycoprotease  47.95 
 
 
255 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1946  peptidase M22 glycoprotease  48.36 
 
 
255 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2077  peptidase M22, glycoprotease  48.36 
 
 
255 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  44.12 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  44.11 
 
 
267 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  45.49 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  46.64 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5354  peptidase M22, glycoprotease  46.72 
 
 
255 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0370  peptidase M22 glycoprotease  46.96 
 
 
248 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  45.22 
 
 
243 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  43.22 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1232  peptidase M22 glycoprotease  46.81 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  0.181812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  41.41 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1306  peptidase M22 glycoprotease  43.97 
 
 
246 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.269549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  42.15 
 
 
224 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  41.38 
 
 
223 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  41.26 
 
 
224 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  41.26 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  40.09 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  35.68 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  35.68 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  35.68 
 
 
231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  41.78 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  35.68 
 
 
231 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  35.68 
 
 
231 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  40.97 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  39.47 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  40.81 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  38.33 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  38.67 
 
 
233 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2257  peptidase M22 glycoprotease  41.88 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0733925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  43.29 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  36.12 
 
 
233 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  36.02 
 
 
239 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  36.73 
 
 
233 aa  125  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  36.44 
 
 
233 aa  124  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0301  putative transmembrane protein  44.64 
 
 
243 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.903385  normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  35.24 
 
 
231 aa  122  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  33.04 
 
 
231 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  33.9 
 
 
231 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  33.9 
 
 
231 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  33.04 
 
 
231 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  33.9 
 
 
231 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  33.9 
 
 
231 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  34.45 
 
 
238 aa  121  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  33.47 
 
 
231 aa  121  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  32.6 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  34.35 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  36.36 
 
 
237 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  34.96 
 
 
233 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  36.44 
 
 
233 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  36 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  36 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  36 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  42.5 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  34.93 
 
 
223 aa  118  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  38.89 
 
 
239 aa  118  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  38.17 
 
 
229 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  33.48 
 
 
233 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  36.55 
 
 
237 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  35.09 
 
 
234 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  40.09 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  34.57 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  35.19 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  37.45 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  35.75 
 
 
236 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  34.5 
 
 
223 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  32.3 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  37.55 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  34.67 
 
 
238 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  36.13 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  36.97 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  33.04 
 
 
234 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  34.22 
 
 
236 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  32.49 
 
 
247 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  34.55 
 
 
226 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  32.3 
 
 
233 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  34.09 
 
 
226 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  34.08 
 
 
236 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>