101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3884 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  80.49 
 
 
489 aa  801    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3884  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
492 aa  989    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00847826  normal  0.748591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0532  FAD dependent oxidoreductase  73.57 
 
 
493 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000340495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3157  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  97.36 
 
 
492 aa  960    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94121  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.04 
 
 
491 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1449  putative transmembrane oxidoreductase protein  67.53 
 
 
486 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1759  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.48 
 
 
499 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1881  putative transmembrane oxidoreductase protein  67.37 
 
 
504 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0519373  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0812  FAD dependent oxidoreductase  63.24 
 
 
504 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2082  FAD dependent oxidoreductase  64.57 
 
 
499 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  58.11 
 
 
486 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  58.47 
 
 
486 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5315  FAD dependent oxidoreductase  57.93 
 
 
474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5104  monooxygenase FAD-binding  58.56 
 
 
474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.16994 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3581  monooxygenase, FAD-binding  57.89 
 
 
486 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2537  FAD dependent oxidoreductase  57.29 
 
 
477 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3939  monooxygenase FAD-binding  57.05 
 
 
486 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115195  normal  0.833441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0669  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.62 
 
 
496 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.488683  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1796  FAD dependent oxidoreductase  52.81 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3851  hypothetical protein  50.21 
 
 
488 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  52.34 
 
 
498 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.256628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0222  hypothetical protein  41.58 
 
 
484 aa  319  9e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0134124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2112  oxidoreductase  38.74 
 
 
478 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3152  FAD dependent oxidoreductase  39.75 
 
 
473 aa  295  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0103  hypothetical protein  35.51 
 
 
480 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5281  oxidoreductase  37.05 
 
 
493 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4836  hypothetical protein  35.76 
 
 
479 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2162  oxidoreductase  35.91 
 
 
505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695444  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1848  hypothetical protein  37.56 
 
 
480 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0114  putative monooxygenase  34.09 
 
 
482 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2767  oxidoreductase  33.55 
 
 
482 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03790  monoxygenase  53.23 
 
 
230 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
419 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09242  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 
610 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.418882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3815  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.43 
 
 
505 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
484 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6282  putative dimethylaniline monooxygenase (N-oxide-forming)  28.25 
 
 
495 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.55 
 
 
470 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00508796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2389  flavin-containing monooxygenase FMO  31.9 
 
 
448 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3885  flavin-containing monooxygenase  27.4 
 
 
505 aa  50.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  29.05 
 
 
419 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.84 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6858  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.73 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7004  Flavin-containing monooxygenase  30 
 
 
417 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5675  flavin-containing monooxygenase FMO  31.9 
 
 
470 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.217019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  26.36 
 
 
310 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.33 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  33.82 
 
 
491 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  24.05 
 
 
480 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5404  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0828166 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7079  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
440 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0768743 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6042  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
459 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.058628  hitchhiker  0.000730698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28 
 
 
348 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  30.86 
 
 
525 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6991  flavin-containing monooxygenase FMO  31.43 
 
 
446 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.771544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.12 
 
 
393 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  26.92 
 
 
378 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2482  putative oxidoreductase  22.99 
 
 
446 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3159  hypothetical protein  25.25 
 
 
344 aa  47.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  27 
 
 
529 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.51 
 
 
448 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.48 
 
 
378 aa  47  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3466  hypothetical protein  35.14 
 
 
449 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0316  cyclohexanone monooxygenase  25.37 
 
 
656 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140448  normal  0.328483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.11 
 
 
367 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0442  flavin-containing monooxygenase FMO  29.52 
 
 
419 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.14 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  28.4 
 
 
493 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.66 
 
 
536 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  33.33 
 
 
376 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  24.32 
 
 
317 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0615  cyclohexanone monooxygenase  32.02 
 
 
489 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.464865  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  36.89 
 
 
443 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.33 
 
 
516 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.95 
 
 
399 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0074  monooxygenase flavin-binding family protein  27.53 
 
 
484 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3649  flavin-containing monooxygenase FMO  28.84 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4608  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
556 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  28.36 
 
 
884 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3030  hypothetical protein  33.56 
 
 
427 aa  45.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101073  normal  0.976263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  30 
 
 
439 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  27.35 
 
 
496 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  28.92 
 
 
499 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3634  glutamate synthase subunit beta  24.82 
 
 
472 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2952  glutamate synthase subunit beta  23.51 
 
 
468 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  25.6 
 
 
347 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 
361 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  29.39 
 
 
524 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  28.83 
 
 
550 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2255  putative flavoprotein  33.33 
 
 
419 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.435784  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.9 
 
 
372 aa  43.9  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.27 
 
 
437 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2129  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
517 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.788233  normal  0.83266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2790  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  25.78 
 
 
458 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  26.73 
 
 
445 aa  43.5  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  48 
 
 
465 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  29.38 
 
 
439 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  26.39 
 
 
491 aa  43.5  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.57 
 
 
362 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>