219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3838 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
420 aa  838    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  97.86 
 
 
420 aa  824    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  59.76 
 
 
417 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  58.37 
 
 
428 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  53.33 
 
 
410 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  42.55 
 
 
399 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  37.86 
 
 
398 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  36.41 
 
 
405 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  29.08 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  27.25 
 
 
403 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  26.35 
 
 
403 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  28.4 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  26.82 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  28.5 
 
 
416 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  26.12 
 
 
403 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  26.76 
 
 
403 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  25.24 
 
 
400 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  25.77 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  26.39 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  24.88 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  25.65 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  25.65 
 
 
396 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  27.19 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  26.12 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  26.35 
 
 
402 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  25.42 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  25.84 
 
 
412 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  25.12 
 
 
404 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  27.19 
 
 
411 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  25.17 
 
 
404 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  26.96 
 
 
411 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 
402 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  26.91 
 
 
408 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  25.46 
 
 
420 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  25.35 
 
 
400 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  27.17 
 
 
410 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  25.6 
 
 
439 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  23.93 
 
 
406 aa  99.4  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  25.17 
 
 
400 aa  98.2  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  24.71 
 
 
400 aa  97.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 
401 aa  96.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 
401 aa  96.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  24.16 
 
 
433 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  24.6 
 
 
407 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  27.52 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  31.75 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  22.09 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  30.17 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  23.69 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  23.22 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  21.23 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  32.5 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  32.21 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  32.21 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  32.21 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  21.67 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  32.67 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  32.67 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  32.67 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  32.5 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  25.23 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  27.51 
 
 
317 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  31.97 
 
 
317 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  32.67 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  31.97 
 
 
317 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  31.97 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  23.02 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  31.97 
 
 
317 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  31.97 
 
 
317 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  27.14 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  32.65 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  26.22 
 
 
411 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2353  flagellar hook-associated protein FlgL  22.82 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  32.67 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  26.84 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  31.08 
 
 
532 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  30.43 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  24.65 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  24.65 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  24.65 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  24.65 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  24.65 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  24.65 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  31.14 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  30.2 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  30.2 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  30.2 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  27.78 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  27.78 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  29.46 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  24.65 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  29.25 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  31.5 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  31.85 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  26.9 
 
 
328 aa  67  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  32 
 
 
296 aa  67  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  26.9 
 
 
521 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  28.26 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>