44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3803 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3803  flagellar export protein FliJ  100 
 
 
154 aa  303  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3077  flagellar export protein FliJ  98.7 
 
 
154 aa  300  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4391  flagellar export protein FliJ  66.67 
 
 
160 aa  189  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0642  flagellar export protein FliJ  54.17 
 
 
154 aa  150  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0554  flagellar export FliJ  50.68 
 
 
155 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1117  flagellar export protein FliJ  49.32 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0569  flagellar biosynthesis chaperone  40.29 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1020  flagellar export protein FliJ  35.79 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2821  flagellar biosynthesis chaperone  30.14 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0229803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2904  flagellar export protein FliJ  30.15 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24190  flagellar export protein  28.76 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00386348  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2454  flagellar export FliJ  34.43 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00422371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3068  flagellar export protein FliJ  34.43 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481055  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6417  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  33.61 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3087  flagellar export protein FliJ  34.43 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0724627  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1540  flagellar biosynthesis chaperone  27.78 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4266  flagellar biosynthesis chaperone  35.54 
 
 
147 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3453  flagellar biosynthesis chaperone  26.98 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1962  flagellar protein FliJ, putative  26.98 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3065  flagellar export protein FliJ  33.61 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.977726 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5101  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  30.94 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371011  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4727  flagellar export protein FliJ  27.08 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3650  flagellar export protein FliJ  27.08 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.842267  normal  0.866565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1572  flagellar biosynthesis chaperone  28.47 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.483296  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0394  flagellar protein  25.56 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137594  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1349  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  30.61 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50080  flagellar biosynthesis chaperone  31.63 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0139652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3774  flagellar export protein FliJ  29.5 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.871006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2979  flagellar export protein FliJ  31.15 
 
 
152 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3113  flagellar export protein FliJ  31.15 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0162  flagellar FliJ protein  29.5 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.818813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4172  flagellar export protein FliJ  29.63 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0196  flagellar FliJ protein  34.96 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1959  flagellar export FliJ  29.08 
 
 
165 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1502  flagellar biosynthesis chaperone  26.98 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.871829  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0230  flagellar export protein FliJ  32.62 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.732846  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3277  flagellar FliJ protein  32.62 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0413  flagellar export protein FliJ  32.62 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257245  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2935  flagellar export protein FliJ  29.5 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2942  flagellar FliJ protein  32.62 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0293332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2146  flagellar FliJ protein  32.62 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3404  flagellar FliJ protein  32.62 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0218  flagellar export protein FliJ  32.62 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4365  flagellar biosynthesis chaperone  26.19 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.573361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>