185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3724 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  99.64 
 
 
279 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  83.2 
 
 
259 aa  441  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.98 
 
 
277 aa  353  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  68.85 
 
 
256 aa  345  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  69.11 
 
 
287 aa  342  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.76 
 
 
267 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.36 
 
 
242 aa  338  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  58.73 
 
 
253 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.33 
 
 
253 aa  315  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  58.33 
 
 
253 aa  315  7e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  57.94 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.94 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  57.94 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  57.94 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  57.94 
 
 
253 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  58.78 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  58.78 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  58.78 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  58.78 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.18 
 
 
253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  58.78 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.7 
 
 
261 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  57.54 
 
 
253 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  59.62 
 
 
265 aa  301  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  61.92 
 
 
237 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  63.67 
 
 
276 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.44 
 
 
256 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  61.98 
 
 
245 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2538  endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.66 
 
 
260 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  61.16 
 
 
245 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.43 
 
 
264 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.43 
 
 
264 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.84 
 
 
264 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.07 
 
 
257 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.48 
 
 
262 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.84 
 
 
257 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.84 
 
 
257 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.25 
 
 
261 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.12 
 
 
253 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.38 
 
 
250 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.15 
 
 
249 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.23 
 
 
252 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.93 
 
 
251 aa  217  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  45.99 
 
 
251 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.95 
 
 
255 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.15 
 
 
255 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  41.06 
 
 
257 aa  205  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  41.06 
 
 
257 aa  204  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.86 
 
 
250 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.08 
 
 
250 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.98478  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.21 
 
 
257 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  37.8 
 
 
302 aa  185  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.59 
 
 
251 aa  182  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  42.51 
 
 
248 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.62 
 
 
248 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.62 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.52 
 
 
262 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.96 
 
 
251 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.52 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.95 
 
 
257 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.71 
 
 
250 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.02 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.49 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.49 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  37.84 
 
 
270 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.15 
 
 
276 aa  141  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.76 
 
 
252 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.51 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3096  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.51 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3049  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.687036  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 
271 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 
271 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 
271 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 
271 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0102  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.4 
 
 
265 aa  99  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  31.71 
 
 
273 aa  99  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.83 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.28 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  33.83 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  33.83 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.83 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.83 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3386  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.83 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.67 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  31.56 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0213  hypothetical protein  34.47 
 
 
230 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.53 
 
 
265 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.68 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3294  hypothetical protein  34.32 
 
 
230 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.68 
 
 
258 aa  92  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.64 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 
246 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.86 
 
 
232 aa  82  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.3 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>