More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3721 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
377 aa  741    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  97.32 
 
 
374 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  55.11 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  53.21 
 
 
398 aa  342  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  36.56 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  37.8 
 
 
358 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  35.75 
 
 
347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 
364 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  36.28 
 
 
361 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 
363 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  37.22 
 
 
349 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  29.4 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  31.51 
 
 
349 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  37.09 
 
 
383 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  36.91 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  35.67 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  36.67 
 
 
383 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  29.62 
 
 
331 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  29.97 
 
 
345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  42.19 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  34.35 
 
 
348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  37.55 
 
 
336 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  32.95 
 
 
357 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  31.32 
 
 
367 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  28.96 
 
 
345 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  30.93 
 
 
353 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  31.38 
 
 
327 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  28.73 
 
 
333 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  30.58 
 
 
335 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  28.51 
 
 
348 aa  99.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  28.51 
 
 
348 aa  99.8  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  28.51 
 
 
348 aa  99.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  34 
 
 
359 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  35.47 
 
 
383 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  34.05 
 
 
378 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  36.84 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  30.92 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  30.69 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  24.46 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  31.14 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  31.91 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  32.09 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.31 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  35.33 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  40.87 
 
 
231 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.54 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  33.33 
 
 
376 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  32.58 
 
 
262 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 
282 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  27.14 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.17 
 
 
278 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  29.21 
 
 
268 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  31.64 
 
 
475 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 
445 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  31.69 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  35.63 
 
 
494 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 
489 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  31.79 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  32.62 
 
 
268 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  36.36 
 
 
513 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  33.53 
 
 
489 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 
270 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  33.33 
 
 
479 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  31.84 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  31 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  21.12 
 
 
260 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  34.4 
 
 
483 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  30.36 
 
 
493 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 
502 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  30.54 
 
 
569 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  21.12 
 
 
260 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 
489 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  28.49 
 
 
480 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  36 
 
 
521 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  30.05 
 
 
590 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  34.04 
 
 
573 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  33.93 
 
 
513 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.53 
 
 
268 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  30.43 
 
 
589 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  30.64 
 
 
263 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  30.58 
 
 
593 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  29.82 
 
 
445 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  30.64 
 
 
271 aa  59.7  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  36.57 
 
 
561 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  36.14 
 
 
275 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  30.43 
 
 
560 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  30.23 
 
 
442 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  32.4 
 
 
268 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 
489 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  30.06 
 
 
479 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 
432 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.65 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  30.43 
 
 
572 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  30.43 
 
 
589 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  30.41 
 
 
230 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  30.43 
 
 
572 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>