More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3707 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 319 aa  628  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  99.69 
 
 		 319 aa  626  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  68 
 
 		 312 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  67.22 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  64.65 
 
 		 304 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  64.56 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  64.29 
 
 		 304 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  64.71 
 
 		 332 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  61.43 
 
 		 296 aa  348  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  48.47 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  46.24 
 
 		 293 aa  243  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  47.29 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  43.84 
 
 		 320 aa  232  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  50.88 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  47.62 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  46.01 
 
 		 302 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  47.25 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  43.84 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  47.25 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  44.41 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  43.37 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  43.01 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  44.71 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  44.03 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  43.12 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  42.5 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  43.75 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  41.55 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  41.78 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  41.28 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  41.26 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  40.57 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  39.46 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  39.54 
 
 		 317 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  37.04 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  40.89 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 		 302 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  39.36 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  39.36 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  33.57 
 
 		 331 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  40.37 
 
 		 295 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  39.72 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  37.37 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  41.33 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  39.72 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 		 285 aa  155  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  35.45 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  39.39 
 
 		 303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  34.3 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  33.82 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  37.06 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  29.12 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  31.94 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  35.45 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  34.26 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  37.25 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  34.84 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  33.1 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  32.94 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  37.11 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  36.88 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  29.75 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  35.34 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  31 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  31.89 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  32.6 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  33.82 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  31.63 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  26.24 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  25.9 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  25.93 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  25.93 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  25.93 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  25.93 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  29.64 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  25.56 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0255  cation diffusion facilitator family transporter  28.97 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000211411  hitchhiker  0.0000000259918 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  27.78 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  28.16 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  28.57 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  26.77 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>