147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3489 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  453  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  98.68 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  76.53 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  65.7 
 
 		 209 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  68.37 
 
 		 237 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  53.65 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  53.93 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  52.26 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  52.02 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  45.58 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  52.02 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  47.55 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  47.06 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  47.72 
 
 		 204 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  47.92 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  47.92 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  48.17 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  43 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  47.4 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  41.54 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  40.38 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  44.33 
 
 		 202 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  41.5 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  50.25 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  43.41 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  50 
 
 		 211 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  42.57 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  45.31 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  45.03 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  45.03 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  43.52 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  43.72 
 
 		 204 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  45.32 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  37.98 
 
 		 238 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  41.88 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  43.2 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  44.72 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  42.71 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  40.62 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  42.71 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  37.81 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  37.2 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  39.11 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  42.27 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  38.34 
 
 		 202 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  35.57 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  37.06 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  37.11 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  36.27 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  37.06 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  37.11 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  36.75 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  34.2 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  38.8 
 
 		 200 aa  92  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  38.86 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  38.25 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  46.32 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  26.7 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  27.72 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  30.4 
 
 		 314 aa  68.9  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  23.2 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  29.13 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  31.71 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  27.7 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  27.4 
 
 		 295 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.19 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  24.16 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  28.82 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  31.03 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  23.33 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  27.97 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  26.92 
 
 		 290 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  30.4 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  30.4 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3612  hypothetical protein  27.81 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  29.93 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  23.38 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0209  protein of unknown function DUF161  34.69 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.951556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  27.01 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  29.66 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  27.01 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  24.86 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  24.86 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  24.86 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  24.86 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  24.86 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  27.48 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  26.01 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  25.69 
 
 		 311 aa  53.9  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2110  hypothetical protein  23.64 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3548  protein of unknown function DUF161  31.29 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  24.44 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  29.61 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0880  hypothetical protein  28.17 
 
 		 285 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  28.3 
 
 		 287 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  28.48 
 
 		 311 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  26.24 
 
 		 283 aa  52  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  24.28 
 
 		 297 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>