269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3406 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  99.31 
 
 
289 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  76.92 
 
 
300 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  70.23 
 
 
299 aa  408  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.22 
 
 
302 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  63.67 
 
 
300 aa  361  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  59.8 
 
 
302 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  49.15 
 
 
296 aa  257  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.16 
 
 
312 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  49.53 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  45.82 
 
 
297 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  46.82 
 
 
319 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3051  DMT family permease  50.64 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.300875  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  37.92 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  35.09 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  37.59 
 
 
313 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  37.92 
 
 
299 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  41.11 
 
 
308 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  32.64 
 
 
301 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  33.66 
 
 
345 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.25 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  34.59 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  36.55 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  36.93 
 
 
312 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  34.85 
 
 
306 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  37.12 
 
 
310 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  36.93 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  36.93 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  36.93 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  36.93 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  36.93 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  36.93 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  34.66 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  36.18 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 
317 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.51 
 
 
301 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 
310 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  30.18 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  33.45 
 
 
294 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
309 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.99 
 
 
301 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.68 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  34.41 
 
 
303 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  38.49 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  33.22 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  31.03 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.14 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  32.99 
 
 
311 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 
291 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.41 
 
 
302 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 
298 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.97 
 
 
303 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.97 
 
 
303 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.97 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.37 
 
 
303 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.48 
 
 
303 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.37 
 
 
303 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.74 
 
 
303 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  29.37 
 
 
303 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  29.06 
 
 
303 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.85 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.79 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  30.95 
 
 
324 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  33.9 
 
 
312 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 
314 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 
305 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  29.9 
 
 
295 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 
305 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  31.74 
 
 
297 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  31.54 
 
 
322 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  35.29 
 
 
315 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
307 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  30.67 
 
 
309 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  28.77 
 
 
325 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  33.67 
 
 
325 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  29.02 
 
 
341 aa  99.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  29.17 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  33.56 
 
 
319 aa  95.9  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  30.07 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  29.86 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  31.49 
 
 
290 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  30.45 
 
 
293 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  30.1 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  28.97 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  25.84 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  26.38 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  27.97 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25.5 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  28.98 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  29.76 
 
 
297 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 
297 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  25.35 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 
297 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  29.73 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>