117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3283 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3283  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2636  protein of unknown function DUF177  99.45 
 
 
183 aa  367  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1180  hypothetical protein  80.11 
 
 
183 aa  299  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3263  hypothetical protein  71.91 
 
 
184 aa  263  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1727  hypothetical protein  51.98 
 
 
182 aa  173  1e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5275  hypothetical protein  60.77 
 
 
185 aa  167  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3079  hypothetical protein  44.81 
 
 
184 aa  163  1e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3653  hypothetical protein  47.9 
 
 
168 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1386  protein of unknown function DUF177  54.4 
 
 
185 aa  141  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0614  hypothetical protein  45.5 
 
 
190 aa  139  2e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1047  hypothetical protein  36.72 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.785486  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0977  protein of unknown function DUF177  38.42 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2012  hypothetical protein  36.42 
 
 
187 aa  84.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2186  hypothetical protein  36.98 
 
 
211 aa  75.5  4e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.111774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0395  hypothetical protein  31.87 
 
 
191 aa  74.7  6e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.822595  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2268  hypothetical protein  31.47 
 
 
201 aa  74.3  1e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1510  hypothetical protein  37.42 
 
 
174 aa  73.6  2e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0199831  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4230  hypothetical protein  36.98 
 
 
211 aa  72.8  3e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879956  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1806  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  71.6  6e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2483  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  71.6  6e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2799  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  71.6  6e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2795  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  71.6  6e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2856  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  71.6  6e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2910  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  71.6  6e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0527  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  71.6  6e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0912  protein of unknown function DUF177  34.09 
 
 
178 aa  71.2  7e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802583  normal  0.107154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1118  hypothetical protein  35.94 
 
 
211 aa  68.6  5e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2128  hypothetical protein  30.65 
 
 
173 aa  68.6  5e-11  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023042  normal  0.0264817 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1076  hypothetical protein  35.94 
 
 
211 aa  68.2  6e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2471  hypothetical protein  33.11 
 
 
174 aa  68.2  6e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.59273e-07  hitchhiker  0.00620906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2781  hypothetical protein  33.11 
 
 
174 aa  68.2  6e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2401  hypothetical protein  33.11 
 
 
174 aa  68.2  6e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.62111e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0638  hypothetical protein  35.94 
 
 
211 aa  68.2  6e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469855  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0402  protein of unknown function DUF177  28.19 
 
 
191 aa  67.8  8e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1714  hypothetical protein  34.21 
 
 
210 aa  67  1e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1069  hypothetical protein  35.04 
 
 
166 aa  67  1e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429486  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2190  hypothetical protein  29.94 
 
 
178 aa  67.4  1e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1577  hypothetical protein  32.89 
 
 
174 aa  66.6  2e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.16707e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2653  hypothetical protein  32.24 
 
 
174 aa  66.2  2e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  8.20152e-09  hitchhiker  3.66748e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2037  hypothetical protein  30.07 
 
 
174 aa  65.5  4e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.25431e-07  normal  0.0155007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0998  hypothetical protein  34.38 
 
 
211 aa  65.9  4e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1711  hypothetical protein  31.58 
 
 
174 aa  65.5  4e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.54481e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2563  hypothetical protein  36.44 
 
 
174 aa  65.9  4e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.29312e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0994  hypothetical protein  34.38 
 
 
211 aa  65.9  4e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14880  hypothetical protein  32.6 
 
 
175 aa  65.1  5e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2298  hypothetical protein  33.11 
 
 
174 aa  65.1  5e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.85744e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1494  hypothetical protein  29.67 
 
 
174 aa  65.1  6e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  9.69755e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25620  hypothetical protein  29.38 
 
 
178 aa  64.7  6e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00500507  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1625  hypothetical protein  31.03 
 
 
173 aa  64.7  8e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1714  hypothetical protein  31.58 
 
 
174 aa  64.3  9e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.35289e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1754  hypothetical protein  31.58 
 
 
174 aa  64.3  9e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.80096e-08  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2629  hypothetical protein  30.72 
 
 
174 aa  64.3  9e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.83088e-08  hitchhiker  1.64508e-06 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2433  hypothetical protein  38.4 
 
 
205 aa  63.5  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1598  hypothetical protein  30.52 
 
 
174 aa  62.8  2e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.26789e-08  hitchhiker  0.000998263 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  31.67 
 
 
181 aa  62.4  3e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2915  protein of unknown function DUF177  32.14 
 
 
214 aa  62.4  4e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2293  hypothetical protein  36.04 
 
 
170 aa  62.4  4e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0163  hypothetical protein  32.93 
 
 
174 aa  61.6  6e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00796864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1069  hypothetical protein  31 
 
 
217 aa  60.5  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959716  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1624  hypothetical protein  30.43 
 
 
175 aa  60.5  1e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0867  protein of unknown function DUF177  30.56 
 
 
169 aa  60.1  2e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0513  hypothetical protein  23.96 
 
 
197 aa  59.7  2e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223212  hitchhiker  0.00953865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1985  hypothetical protein  30.87 
 
 
174 aa  60.1  2e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.6877e-07  decreased coverage  0.000655562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002991  hypothetical protein YceD (clustered with ribosomal protein L32p)  31.18 
 
 
174 aa  59.7  3e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.52576e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0518  hypothetical protein  25.52 
 
 
197 aa  59.3  3e-08  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.993145  hitchhiker  0.00918152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0825  hypothetical protein  33.87 
 
 
212 aa  58.9  4e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2813  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  58.5  5e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.46224e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2499  hypothetical protein  30.46 
 
 
174 aa  58.2  6e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.06501e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1612  hypothetical protein  29.12 
 
 
174 aa  58.2  6e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.08475e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1901  hypothetical protein  37.5 
 
 
173 aa  57.4  1e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  8.44005e-11  hitchhiker  6.03572e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2431  protein of unknown function DUF177  29.89 
 
 
174 aa  56.6  2e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0999209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02913  hypothetical protein  29.67 
 
 
174 aa  57  2e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1114  hypothetical protein  28.65 
 
 
169 aa  57  2e-07  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.510679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1208  hypothetical protein  28.65 
 
 
169 aa  57  2e-07  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02336  hypothetical protein  29.17 
 
 
220 aa  56.2  2e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  1.24233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1084  hypothetical protein  27.33 
 
 
173 aa  56.2  3e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.181417  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2508  hypothetical protein  28.02 
 
 
173 aa  55.8  3e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  2.57627e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01092  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  55.5  4e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.03492e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2039  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  55.5  4e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.23338e-10  hitchhiker  3.03245e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1210  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  55.5  4e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.84281e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1681  hypothetical protein  33.64 
 
 
174 aa  55.8  4e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.42559e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3504  hypothetical protein  33.64 
 
 
174 aa  55.8  4e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.22055e-08  hitchhiker  0.00648337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1573  hypothetical protein  33.64 
 
 
174 aa  55.8  4e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.25555e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01084  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  55.5  4e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.18944e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1597  hypothetical protein  28.73 
 
 
175 aa  55.5  5e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.16577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1618  hypothetical protein  34.51 
 
 
173 aa  55.1  6e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  8.31476e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02704  hypothetical protein  31.09 
 
 
156 aa  54.7  7e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1996  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  53.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  8.50849e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1260  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  53.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.96903e-06  normal  0.293656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1304  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  53.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0170278  hitchhiker  5.2483e-10 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2179  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  53.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.45299e-05  hitchhiker  1.56783e-12 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1289  hypothetical protein  30.43 
 
 
173 aa  53.5  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0001847  hitchhiker  2.30682e-13 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0454  hypothetical protein  26.32 
 
 
215 aa  53.9  1e-06  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180134  normal  0.312368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1603  hypothetical protein  29.67 
 
 
173 aa  53.9  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.20656e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2236  hypothetical protein  29.73 
 
 
173 aa  54.3  1e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.70485e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1210  hypothetical protein  29.73 
 
 
173 aa  54.3  1e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.98054e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2513  hypothetical protein  29.73 
 
 
173 aa  54.3  1e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  9.85112e-09  hitchhiker  6.61717e-05 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1604  protein of unknown function DUF177  29.87 
 
 
173 aa  53.5  2e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141183  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2559  protein of unknown function DUF177  29.89 
 
 
173 aa  52  4e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.87302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1554  hypothetical protein  25.69 
 
 
139 aa  51.6  6e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.576052  normal  0.0687632 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>