251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3243 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  99.53 
 
 
215 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  100 
 
 
215 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  65.24 
 
 
222 aa  260  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  60.47 
 
 
209 aa  255  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  58.56 
 
 
229 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  56.31 
 
 
230 aa  241  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  57.48 
 
 
224 aa  240  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  55.24 
 
 
223 aa  232  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  55.07 
 
 
234 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  44.23 
 
 
207 aa  167  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.92 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.76 
 
 
214 aa  154  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  42.45 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  43 
 
 
200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  42.36 
 
 
220 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.15 
 
 
211 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.71 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.71 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  36.82 
 
 
194 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.28 
 
 
211 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  38.28 
 
 
211 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.28 
 
 
211 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  37.74 
 
 
211 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  37.21 
 
 
210 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  37.69 
 
 
210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.09 
 
 
190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  35.98 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  38.21 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.51 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  37.5 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  38.21 
 
 
210 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  38.21 
 
 
210 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  38.21 
 
 
210 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  38.21 
 
 
210 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  38.21 
 
 
210 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  37 
 
 
217 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  38.21 
 
 
210 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  38.21 
 
 
210 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  39.78 
 
 
196 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  38.92 
 
 
202 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  37 
 
 
216 aa  121  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.14 
 
 
196 aa  118  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.61 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  35.61 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  35.29 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  37.62 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.6 
 
 
194 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  37.11 
 
 
192 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.98 
 
 
196 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  36.41 
 
 
194 aa  99.4  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.66 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.66 
 
 
196 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.85 
 
 
193 aa  95.5  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  34.65 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  35.78 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  34.8 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  29.56 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  29.06 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  46.94 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  45.92 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  30.35 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.88 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  46.32 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  32.77 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  26 
 
 
182 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.46 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.36 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  33.49 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  30.5 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  42.42 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  45.74 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.95 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.46 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.46 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.41 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.46 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  28 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.41 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.66 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  29.71 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.7 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  32.67 
 
 
185 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.14 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  32.67 
 
 
185 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  37.4 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  25.49 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  29.13 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  43.3 
 
 
265 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  41.24 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.94 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  39.02 
 
 
213 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  37.58 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.52 
 
 
233 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.76 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  39.25 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  27.54 
 
 
828 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  37.5 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.06 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  37.89 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>