More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3212 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  87.08 
 
 		 472 aa  844    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  73.05 
 
 		 473 aa  687    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  80.51 
 
 		 468 aa  774    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  100 
 
 		 472 aa  963    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  100 
 
 		 472 aa  963    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  88.47 
 
 		 477 aa  846    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  75.66 
 
 		 471 aa  684    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  83.41 
 
 		 469 aa  787    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  88.4 
 
 		 473 aa  864    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  80.04 
 
 		 469 aa  765    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  66.08 
 
 		 463 aa  612  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  65.86 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  65.41 
 
 		 462 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  65.19 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  64.75 
 
 		 473 aa  596  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  61.66 
 
 		 461 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  61.66 
 
 		 461 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  62.14 
 
 		 460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  62.14 
 
 		 460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  61.92 
 
 		 460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  62.14 
 
 		 460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  61.4 
 
 		 460 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  61.4 
 
 		 460 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  61.4 
 
 		 460 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  61.4 
 
 		 460 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  61.4 
 
 		 460 aa  568  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  61.92 
 
 		 460 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  61.4 
 
 		 460 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  61.4 
 
 		 460 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  61.4 
 
 		 460 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  61.28 
 
 		 462 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  61.62 
 
 		 460 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  61.37 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  59.17 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  59.78 
 
 		 470 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  60.58 
 
 		 463 aa  541  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  57.86 
 
 		 465 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  58.04 
 
 		 470 aa  518  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  57.73 
 
 		 461 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  59.01 
 
 		 479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  55.43 
 
 		 465 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  55.65 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  54.99 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  55.13 
 
 		 461 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  55.21 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  54.92 
 
 		 472 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  54.23 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  54.23 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  53.88 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  52.3 
 
 		 472 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  53.66 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  53.88 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  54.69 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  54.61 
 
 		 476 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  53.25 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  53.14 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  53.66 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  52.75 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  52.91 
 
 		 460 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  52.34 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  54.77 
 
 		 476 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  52.56 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  52.56 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  52.56 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  52.12 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  52.12 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  51.89 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  51.45 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  51.45 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  53.25 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  51.89 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  51.45 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  51.89 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  51.45 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  53.25 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  52.12 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  51.76 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  51.43 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  50 
 
 		 467 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 468 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 458 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 468 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  53.02 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  50.55 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  50.99 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  51.11 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  51.67 
 
 		 468 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  49.23 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 471 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 451 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  51.14 
 
 		 466 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 471 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>