More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3114 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  98.52 
 
 		 877 aa  1632    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  62.77 
 
 		 867 aa  887    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  62.63 
 
 		 868 aa  872    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  55.74 
 
 		 853 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  63.21 
 
 		 855 aa  855    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  63.52 
 
 		 866 aa  858    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  63.46 
 
 		 857 aa  899    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  100 
 
 		 877 aa  1655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  63.76 
 
 		 884 aa  939    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  58.5 
 
 		 844 aa  735    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  43.42 
 
 		 855 aa  543  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  43.24 
 
 		 858 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  44.93 
 
 		 846 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  43.41 
 
 		 857 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 		 835 aa  346  8.999999999999999e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  37.98 
 
 		 835 aa  346  8.999999999999999e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  28.57 
 
 		 849 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.7 
 
 		 858 aa  225  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  43.48 
 
 		 408 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  43.22 
 
 		 445 aa  211  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.3 
 
 		 850 aa  207  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  27.48 
 
 		 855 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.61 
 
 		 866 aa  196  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.89 
 
 		 870 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  32.61 
 
 		 841 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  30.95 
 
 		 843 aa  182  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 		 847 aa  172  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 		 837 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.33 
 
 		 851 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 		 847 aa  164  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.39 
 
 		 845 aa  160  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.59 
 
 		 850 aa  156  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  37.22 
 
 		 842 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  36.89 
 
 		 842 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 		 842 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 		 849 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 		 849 aa  107  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 848 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  29.34 
 
 		 846 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  21.97 
 
 		 817 aa  99.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  25.51 
 
 		 843 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  22.01 
 
 		 817 aa  95.1  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 839 aa  92.8  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  27.25 
 
 		 826 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  31.82 
 
 		 843 aa  89.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  23.57 
 
 		 845 aa  89  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  23.19 
 
 		 897 aa  87  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  26.13 
 
 		 820 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  20.87 
 
 		 817 aa  87  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 871 aa  86.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  26.3 
 
 		 793 aa  85.5  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  22.45 
 
 		 887 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  23.41 
 
 		 850 aa  84  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  25.44 
 
 		 847 aa  84  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  23.04 
 
 		 889 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  24.13 
 
 		 879 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  22.9 
 
 		 889 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  22.74 
 
 		 878 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 834 aa  80.5  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.06 
 
 		 842 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  25.3 
 
 		 800 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  25.67 
 
 		 815 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  22.36 
 
 		 840 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 		 821 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  26.61 
 
 		 820 aa  78.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  23.31 
 
 		 887 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  26.59 
 
 		 821 aa  77.8  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  24.37 
 
 		 836 aa  77.8  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  28.53 
 
 		 821 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  28.33 
 
 		 827 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 		 839 aa  75.1  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  28.69 
 
 		 819 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  26.91 
 
 		 858 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  27.21 
 
 		 857 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.68 
 
 		 853 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 		 859 aa  72  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  26.33 
 
 		 825 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 		 930 aa  71.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  28.14 
 
 		 819 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  25.14 
 
 		 889 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  24.74 
 
 		 836 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  25.45 
 
 		 849 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  27.8 
 
 		 856 aa  66.6  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 		 838 aa  65.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  21.14 
 
 		 803 aa  65.1  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.09 
 
 		 835 aa  65.1  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  22.43 
 
 		 849 aa  64.3  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.82 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  29.18 
 
 		 819 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  26.19 
 
 		 819 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 		 884 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  26.41 
 
 		 855 aa  63.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 		 853 aa  62.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4468  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 		 855 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.97 
 
 		 800 aa  62  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  23.53 
 
 		 856 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  24.84 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 873 aa  60.8  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  24.37 
 
 		 836 aa  60.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>